小鲨鱼2018

2025年3月8日

摘要： 001、 [root@PC1 test]# echo ${array1[*]} 100 aaa xxxYYY [root@PC1 test]# echo ${array1[@]} 100 aaa xxxYYY [root@PC1 test]# echo ${!array1[@]} 0 1 2 [ro 阅读全文

posted @ 2025-03-08 20:40 小鲨鱼2018 阅读(24) 评论(0) 推荐(0)

Linux 中 sh -c

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.sh [root@PC1 test]# cat a.sh #!/bin/bash echo hello world [root@PC1 test]# sh -c bash a.sh ## 更新了系统环境变量？ (base) [root@PC1 t 阅读全文

posted @ 2025-03-08 10:22 小鲨鱼2018 阅读(53) 评论(0) 推荐(0)

Linux 中 xargs -i选项用法

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt b.txt test [root@PC1 test]# tree . ├── a.txt ├── b.txt └── test 1 directory, 2 files [root@PC1 test]# find *.txt a.txt 阅读全文

posted @ 2025-03-08 10:14 小鲨鱼2018 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)

2025年3月6日

linux 中sed命令删除指定分割符及其最后的一个域

摘要： 001、 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 W-URI-20 W-HYB-21 aaa fff-ddd-eee ZOM-1 ZOM-9 AWA-A-1 AWA-A-6 [root@PC1 test2]# se 阅读全文

posted @ 2025-03-06 09:10 小鲨鱼2018 阅读(17) 评论(0) 推荐(0)

使用PopLDdecay进行连锁不平衡分析

摘要： 001、软件下载： github网站：https://github.com/BGI-shenzhen/PopLDdecay 002、下载最新版本 wget -c https://github.com/BGI-shenzhen/PopLDdecay/archive/refs/tags/v3.43.t 阅读全文

posted @ 2025-03-06 00:15 小鲨鱼2018 阅读(334) 评论(0) 推荐(0)

2025年3月5日

phylip 中利用NJ法构建进化树

摘要： 001、测试文件vcf文件 (base) [b20223040323@admin2 02_NJ_tree]$ ls outcome.vcf 002、格式转换；输入文件为vcf文件 run_pipeline.pl -Xms1G -Xmx5G -importGuess outcome.vcf -Expo 阅读全文

posted @ 2025-03-05 23:38 小鲨鱼2018 阅读(153) 评论(0) 推荐(0)

Linux 中 phylip软件的安装

摘要： Linux 中 phylip软件的安装 001、官方网站：https://phylipweb.github.io/phylip/ 002、下载安装包： a、 b、 c、 wget -c https://phylipweb.github.io/phylip/download/phylip-3.697. 阅读全文

posted @ 2025-03-05 19:29 小鲨鱼2018 阅读(59) 评论(0) 推荐(0)

2025年3月3日

R语言中快速生成多个有色差的颜色

摘要： 001、 library(randomcoloR) palette <- randomColor(count = 54) #随机生成60种颜色，其实里面有重复的 palette <- distinctColorPalette(54) #差异明显的60种 palette plot(1:54, pch 阅读全文

posted @ 2025-03-03 09:50 小鲨鱼2018 阅读(79) 评论(0) 推荐(0)

2025年2月25日

R语言中points 函数

摘要： 001、R语言中points 函数 plot(1:5, 1:5, xlim = c(1,6), ylim = c(1,6), type = "n") points(c(3,3), c(2,5), cex = 2, col = "red", pch = 13) 002、调整大小、颜色 plot(1: 阅读全文

posted @ 2025-02-25 09:49 小鲨鱼2018 阅读(36) 评论(0) 推荐(0)

2025年2月24日

R语言中数据框中如何实现按照指定列的类别进行排序

摘要： R语言中数据框中如何实现按照指定列的类别进行排序。 001、 dir() c1 <- rep(c("b","d", "a", "c"), each = 2) c1 c2 <- sample(1:20, 8) c2 dat <- data.frame(c1, c2) ## 生成一个测试数据 idx < 阅读全文

posted @ 2025-02-24 17:17 小鲨鱼2018 阅读(20) 评论(0) 推荐(0)

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