小鲨鱼2018

摘要： 001、 [root@localhost test]# ls a.txt [root@localhost test]# cat a.txt ## 测试文本 gene mRNA exon exon exon exon exon exon exon CDS CDS CDS CDS exon CDS ge 阅读全文

摘要： 001、将fasta碱基转换为一行 (base) [b20223040323@admin2 test11]$ ls a.fasta (base) [b20223040323@admin2 test11]$ cat a.fasta >chr1 AANNNAACC CCNNTTTTN NNGGGG >c 阅读全文

摘要： 001、awk (base) [b20223040323@admin2 test11]$ ls a.fasta (base) [b20223040323@admin2 test11]$ cat a.fasta ## 测试fasta文件 >chr1 xxx yyy AAAACCCCTTTT GGGG 阅读全文

摘要： Linux 中文本显示字体以颜色突出 001、绿色 002、红色 阅读全文

摘要： 001、 seqkit实现 (cactus_env) [b20223040323@admin2 test]$ ls test.fa (cactus_env) [b20223040323@admin2 test]$ cat test.fa ## 测试fasta文件 >scaffold1 xxx yyy 阅读全文

摘要： 001、gzip [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# ll -h total 39M -rw-r--r--. 1 root root 39M Dec 7 11:28 a.txt [root@PC1 test]# gzip -c a.txt > a.t 阅读全文

摘要： seqkit命令对fasta文件scaffold批量重命名 001、查看原始的scaffold名称： (base) [b20223040323@admin2 GCA_024222265.1_ASM2422226v1]$ grep "^>" GCA_024222265.1_ASM2422226v1_g 阅读全文

摘要： library("devtools")install_github("dwinter/pafr")library(pafr) 阅读全文

摘要： gzip、pigz、zstd压缩率、运算时间对比 001、 测试数据 (base) [b20223040323@admin2 test]$ ll -h 总用量 856M -rw-rw-r-- 1 b20223040323 b20223040323 428M 12月 2 15:18 SRR177041 阅读全文

摘要： 001、 测试文件 (base) [b20223040323@admin2 test]$ du -ch *.fastq3.4G SRR33287865_1.fastq 002、gzip gzip -c SRR33287865_1.fastq Elapsed time: 238 003、pigz pi 阅读全文