小鲨鱼2018

摘要： 001、 软件下载： github网站：https://github.com/BGI-shenzhen/PopLDdecay 002、下载最新版本 wget -c https://github.com/BGI-shenzhen/PopLDdecay/archive/refs/tags/v3.43.t 阅读全文

摘要： 001、测试文件vcf文件 (base) [b20223040323@admin2 02_NJ_tree]$ ls outcome.vcf 002、格式转换；输入文件为vcf文件 run_pipeline.pl -Xms1G -Xmx5G -importGuess outcome.vcf -Expo 阅读全文

摘要： Linux 中 phylip软件的安装 001、官方网站：https://phylipweb.github.io/phylip/ 002、下载安装包： a、 b、 c、 wget -c https://phylipweb.github.io/phylip/download/phylip-3.697. 阅读全文

摘要： 001、 library(randomcoloR) palette <- randomColor(count = 54) #随机生成60种颜色，其实里面有重复的 palette <- distinctColorPalette(54) #差异明显的60种 palette plot(1:54, pch 阅读全文

摘要： 001、R语言中points 函数 plot(1:5, 1:5, xlim = c(1,6), ylim = c(1,6), type = "n") points(c(3,3), c(2,5), cex = 2, col = "red", pch = 13) 002、 调整大小、颜色 plot(1: 阅读全文

摘要： R语言中数据框中如何实现按照指定列的类别进行排序。 001、 dir() c1 <- rep(c("b","d", "a", "c"), each = 2) c1 c2 <- sample(1:20, 8) c2 dat <- data.frame(c1, c2) ## 生成一个测试数据 idx < 阅读全文

摘要： Linux 中sed命令的整行替换. 001、基本用法 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt ## 测试文件 a UU i a UU i b q j c q y [root@PC1 test2]# sed '/b/ s/.*/Q 阅读全文

摘要： 001、 Linuxbash和source命令的区别在于，当你用bash命令执行脚本时，它告诉Linux内核创建一个新的Bash进程来读取和执行脚本，将输出复制到原先的shell进程中，并显示下来. 然而source命令是一个外置的shell，它读取和评估当前shell进程中的文件。为此，脚本所做的 阅读全文

摘要： 001、 创建数组 a、 declare -a array1 。 b、 array1[0]=100 。 002、删除数组 unset array1 。 003、查看数组 a、查看数组所有的元素： [root@PC1 test]# array1[0]=100 [root@PC1 test]# arra 阅读全文

摘要： 001、关联数组的声明 declare -A array1 002、关联数组的赋值 [root@localhost test]# declare -A array1 [root@localhost test]# array1["a"]=1000 [root@localhost test]# arra 阅读全文