随笔分类 - 文献
摘要：基因组选择（Genomic Selection, GS）是一种新兴的植物育种策略，通过高密度分子标记预测目标性状的育种值，从而加速育种进程并降低成本。然而，传统方法在预测复杂性状时存在局限性，因为它们无法充分反映基因型与表型之间复杂的非线性关系。近年来，深度学习（Deep Learning, DL）
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摘要：点击蓝字 关注我们 大豆作为全球食品安全的重要基础，是人类日常生活中高质量植物蛋白质和油脂的重要来源。大豆种质资源丰富，蕴含着宝贵的遗传资源，为育种提供了巨大潜力。多组学技术的发展极大推动了大豆遗传资源的发掘，为精准育种和品种改良提供了强有力支持。 2025年2月19日，Journal of Gen
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摘要：英国詹姆斯·赫顿研究所（James Hutton Institute）Robbie Waugh教授领衔，张润烜博士、过文彬博士团队联合包括澳大利亚默多克大学李承道教授团队、浙江大学张国平教授团队等多家国际研究机构，在Nature Genetics发表了题为_A barley pan-transcri
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摘要：▼ 大豆品种的快速精准分类对质量控制和农业生产具有重要意义。基于高光谱成像的深度学习模型能够有效的对大豆种子进行品种分类，但是当前的种子品种分类深度学习模型未能有效结合局部与全局空间特征，且对小样本数据的适应能力较弱，限制了其实用性。 近日，黑龙江大学联合中国农业科学院作物科学研究所在The Cro
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摘要：近期，Molecular Plant杂志发表了玉米、小麦、大豆、棉花、大麦、苜蓿等六大作物的研究综述以及未来（2035）育种展望。 （公众号后台回复：作物2035，领取pdf文献。） 小编利用阿里云百炼平台的Qwen-Long（长下文模型，需要付费哦，测试的话100万token免费试下），基于上述p
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摘要：最近读到的马铃薯相关的研究和文章越来越多了。当然，黄院士的“优薯计划”影响力功不可没。 （点击下方各标题链接，详细阅读） PBJ | 利用PanTools构建马铃薯单倍体泛基因组 2025年1月5日，荷兰瓦赫宁根大学科研人员在PBJ在线发表“Exploring intra- and intergen
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摘要：Abstract 摘 要 2025年1月28日，华中农业大学玉米团队在Molecular Plant上发表了题为“GEFormer: a Genomic Prediction Method of Genotype-Environment Interaction in Maize by Integra
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摘要：▼ 计算机仿真模拟能够有效地利用育种大数据以及大量的遗传信息，在育种家开展田间试验之前对育种程序中的各种因素进行模拟筛选和优化，提出最佳的亲本组配方案和后代选择方法，提高育种过程中的预见性。模拟预测既是科学研究的重要手段，也是科学化预测和决策的重要方法，而仿真模拟计算机工具研发则是开展育种模拟和预测
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摘要：最近读到的马铃薯相关的研究和文章越来越多了。当然，黄院士的“优薯计划”影响力功不可没。 （点击下方各标题链接，详细阅读） PBJ | 利用PanTools构建马铃薯单倍体泛基因组 2025年1月5日，荷兰瓦赫宁根大学科研人员在PBJ在线发表“Exploring intra- and intergen
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摘要：近日，中国农业科学院烟草所昝艳君和西北农林科技大学赵涛课题组合作开发全基因组选择软件ShinyGS—a graphical toolkit with a serial of genetic and machine learning models for genomic selection: appl
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摘要：近日，安徽农业大学农学院水稻分子育种创新团队联合华中农业大学、中国农业科学院作物科学研究所在《Plant Biotechnology Journal》在线发表了题为“MFMGP: an integrated machine learning fusion model for genomic pred
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摘要：无人机遥感技术已成为作物育种中的一项关键技术，可实现作物表型数据的高通量、无损采集。然而，育种的多学科性质给知识挖掘带来了技术壁垒和效率挑战。因此，开发一种智能育种目标工具对跨域多模态数据的挖掘具有重要意义。基于Qwen-VL、InternVL、Deepseek-VL等不同的预训练开源多模态大型语言
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摘要：随着人口不断增长和工业化水平日益提高，全球气温正在逐年升高，极端天气更加频繁。研究表明，全球平均温度每升高1℃将导致粮食作物产量损失6%-7%。此外，全球变暖引起的极端高温严重限制了植物生长和作物增产，造成水稻、小麦、玉米等粮食作物大幅减产，品质下降。深入挖掘作物耐高温的分子调控网络，利用现代生物技
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摘要：绵羊（Ovis aries）是最早被驯化的家畜之一，其参考基因组的高质量组装对于研究其进化历史、迁徙、遗传多样性以及与特定性状相关的因果突变具有至关重要的意义。自2014年绵羊基因组草图首次公布以来，已有近60个不同品种的绵羊基因组在NCBI发布。反刍动物存在大规模的串联重复序列区域（例如端粒、端着
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摘要：中国农业大学动物科学技术学院李孟华团队联合全球科学家在SCIENCE CHINA Life Sciences上发表题为“Genetic advancements and future directions in ruminant livestock breeding: from reference
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摘要：近日，中国农科院生物所作物耐逆性调控与改良创新团队提出利用有利单倍型优化水稻生长发育培育高产耐盐水稻的新策略：Improving grain yield and salt tolerance by optimizing plant height with beneficial haplotypes
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摘要：Abstract 摘 要 近日，中国农业科学院作物科学研究所联合德国莱布尼茨植物遗传与作物研究所（IPK）、澳大利亚默多克大学（Murdoch University）和丹麦嘉士伯啤酒集团实验室（Carlsberg Research Laboratory），在Molecular Plant发表了题为B
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摘要：Abstract 摘 要 近日，扬州大学农学院张韬教授课题组在_Molecular Plant_在线发表了题为PDLLMs: A group of tailored DNA large language models for analyzing plant genomes的研究论文，开发了一系列基于
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摘要：人类基因组中非编码区域的信息解码一直是基因组学领域的基础性难题，调控元件如何在不同细胞类型中调控基因表达机制的问题至今仍未得到充分解决，非编码变异如何破坏DNA序列底层的调控语法也尚未完全阐明。随着表观基因组测序技术的发展，积累了大量可供研究这些问题的数据，包括染色质可及性、DNA甲基化、组蛋白修饰
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摘要：水稻(Oryza sativa)是保障全球粮食安全的重要农业作物。水稻基因组中的调控元件(包括启动子、增强子、沉默子和绝缘子)在基因表达调控中扮演着核心角色，由于与农艺性状密切相关的大量遗传变异都分布在这些调控区域，研究调控元件的功能对水稻性状的遗传改良至关重要。然而，揭示这些元件的调控密码——即它
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