随笔分类 - 文献
摘要:中国是世界人口最多的国家,在全球谷物生产方面排名第一。通过多样化作物种类的多熟制种植,可以显著增加农作物产量,并减少相关的环境影响。全球约12%的农田实行多熟制,其中34%的水稻地采用多熟制系统。中国用仅占全球7%的耕地养活了世界20%的人口。中国约三分之一的农田种植多熟作物,这一比例是全球平均水平
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摘要:首个豌豆大规模群体基因组与GWAS见刊 今天,浙江省农科院与浙江大学联合在Nature Genetics (NG)上发表豌豆群体基因组文章:Reference genome sequence and population genomic analysis of peas provide insigh
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摘要:近期,中国农大张毅教授联合华南农大张哲团队利用贝叶斯神经网络算法提高了奶牛基因组预测的准确性,文章发表在JASB(一区top)上:Improving the accuracy of genomic prediction in dairy cattle using the biologically a
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摘要:分享一篇去年由中国农科院作物所张红伟和华中农业大学李林团队发表在Cell Reports上的综述文章:Next-generation bulked segregant analysis for Breeding 4.0。 该综述在总结传统混池测序技术(BSA)的基础上,提出了NG-BSA的研究策略。
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摘要:所谓“Speed Breeding”(简称“SB”,额~),就是在环境可控的人工气候室中,通过改变光周期来加速植物的生长周期,从而起到加速育种的目的。 快速育种:加速作物研究和育种的强大工具 2017年7月9日,澳大利亚昆士兰大学Lee Hickey团队领衔在预印本网站bioRxiv上发表了“Spe
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摘要:近期,Rajeev K. Varshney团队在Nature genetics发表综述文章:Unlocking plant genetics with telomere-to-telomere genome assemblies。 摘要 连续基因组序列组装将帮助我们实现作物转化基因组学的全面潜力。最
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摘要:❝ 我们能教会计算机理解人类语言,同样也能让它们读懂DNA。 2023年10月31日,加利福尼亚大学伯克利分校的科学家们在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了一篇突破性研究,提出了一种基于无监督DNA语言模型的新方法,该方法在全基因组范围内预测基因变异效果上,超越了现有的保守性评分模型。 研究团队
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摘要:果树基因组与遗传改良 2023年,南京农业大学吴俊教授团队发表在Plant Physiology的题为 “Genomic insights into domestication and genetic improvement of fruit crops”的长篇综述,系统总结了果树基因组学与遗传改良
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摘要:分享一篇来自南洋理工大学Marek Mutwil团队发表在《Trends in Plant Science》上有关植物生物学方向的大语言模型综述:Large language models in plant biology。生物序列本身就是一种自然语言,与LLM是天作之合,实际上生物大模型已有很多开
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摘要:❝ 我们能教会计算机理解人类语言,同样也能让它们读懂DNA。 2023年10月31日,加利福尼亚大学伯克利分校的科学家们在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了一篇突破性研究,提出了一种基于无监督DNA语言模型的新方法,该方法在全基因组范围内预测基因变异效果上,超越了现有的保守性评分模型。 研究团队
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摘要:Resistify是一个用于快速且准确地注释植物中的NLRs(Nucleotide-binding domain Leucine-rich Repeat,核苷酸结合域富含亮氨酸重复序列)并提供准确结构分类的工具。NLRs是植物先天免疫系统的关键组成部分,具有显著的存在/缺失变异和序列多样性。Resi
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摘要:果树基因组与遗传改良 2023年,南京农业大学吴俊教授团队发表在Plant Physiology的题为 “Genomic insights into domestication and genetic improvement of fruit crops”的长篇综述,系统总结了果树基因组学与遗传改良
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摘要:分享一篇来自南洋理工大学Marek Mutwil团队发表在《Trends in Plant Science》上有关植物生物学方向的大语言模型综述:Large language models in plant biology。生物序列本身就是一种自然语言,与LLM是天作之合,实际上生物大模型已有很多开
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摘要:分享一篇水文,来自海南热带农业资源研究所今年发表在《分子植物育种》上的一篇综述。 摘要 植物育种的未来正在朝着更高的精度、效率和可持续性发展。育种5.0代表了未来植物育种的前沿,通过基因组编辑、人工智能和大数据分析等创新技术和方法彻底改变了该领域,实现了遗传信息的整合和编辑。这将给全球农业带来革命性
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摘要:2024年6月13日,华中农业大学严建兵教授团队在Molecular Plant发表综述:Doubled Haploid Technology and Synthetic Apomixis: Recent Advances and Applications in Future Crop Breedi
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摘要:分享一篇农业大模型综述。 官网全文免费阅读 知网阅读 农业大模型:AI领域的新热点 农业大模型,基于Transformer架构,通过自监督学习方法,在大规模数据上进行训练,展现出了卓越的通用能力和强大的下游任务适应性。这些模型不仅能够处理复杂的关联表示,还在多模态信息处理等方面具有显著优势。 核心技
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摘要:20世纪30年代,Boysen和Heath通过分析叶片结构与净同化率的关系,提出了作物株型概念,明确作物生产过程中叶形和叶片数量的重要性,并进一步揭示了株型对作物生产的决定作用。随后,Donald提出有利于提高光合效率,促进作物生长发育以达高产的多性状综合的株型为理想株型。随着有关理想株型的相关研究
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摘要:近日,中国农业大学农学院汪海团队联合美国康奈尔大学、丹麦奥胡斯大学、北京大学现代农业研究院、坦桑尼亚农业科学院等单位在_PNAS在线发表了题为Modeling 0.6 million genes for the rational design of functional cis-regulatory
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摘要:在作物功能基因组学、数字育种与智慧栽培等的需求牵引下,作物表型组学近年来发展迅速。然而,作物表型组学技术及装备产品的研发与应用缺乏标准规范已成为限制作物表型产业高质量发展的瓶颈问题。 2024年6月,北京市农林科学院信息技术研究中心数字植物北京市重点实验室联合华中农业大学在中国工程院院刊_Engin
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摘要:近期,中国农科院作物所联合国内多家单位,构建了用于水稻基因组选择的大规模中国栽培稻群体数据集,提出了配套的全基因组预测深度学习模型DeepCCR,为育种者快速、高效地培育优良品种提供了有利工具。相关研究成果以简讯方式在线发表在《Plant Biotechnology Journal》上。 水稻是世界
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