随笔分类 - 文献
摘要：提高作物产量的一个关键策略是利用杂交优势。水稻是自花授粉作物，其杂交育种的成功在很大程度上依赖于雄性不育系的发掘和应用。雄性不育系对于杂交水稻的培育至关重要，是实现杂交水稻育种成功的核心要素之一。过去二十多年里，科学家们不断定位并克隆水稻雄性不育基因，逐步揭示了其育性调控的分子机制。 2024年11
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摘要：2024年10月11日，中国农业大学园艺学院高俊平团队在植物学领域国际著名期刊Nature Plants杂志上发表了题为“Haplotype-resolved genome assembly and resequencing provide insights into the origin and
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摘要：我们常说，基因组选择（Genomic Selection，GS）优于传统育种中的表型选择（Phenotypic Selection，也简称“PS”，但不同于我们后面要提到的Phenomic Selection），怎么吹都是为了取代传统的表型调查，直接基于预测的结果来选材料。 Phenotypic a
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摘要：玉米作为一种全球广泛种植的作物，其在全球谷物产量中占比高达37.2%。自上个世纪初单交玉米杂交种开始应用以来，玉米产量实现了超过七倍的增长。迄今为止，通过密集的育种工作，玉米杂交种的密度耐受性、产量潜力、抗病性、耐逆性和适应性等方面都得到了显著提升。近期，中国农业科学院作物科学研究所在《SCIENC
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摘要：分享一篇2024年7月由沈阳农业大学水稻研究所陈温福院士团队徐铨教授在New Phytologist杂志在线发表的文章：“Dissecting the molecular basis of the ultra-large grain formation in rice”。影响因子虽不高（当然是跟近期
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摘要：农业知识智能服务应用场景构建 以数据和知识双驱动的农业智能服务涉及产前规划、产中管理、产后指导等多个环节，面向多类农业用户、打通多维数据，在智能计算能力提升、农业物联网技术普及、机器学习算法进步的背景下，构建多类型农业知识智能服务应用场景，推动知识智能技术在农业领域的深度应用发展。 1 农业产前规划
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摘要：自1970年Susumu Ohno发表了其具有深远影响的著作《Evolution by Gene Duplication》以来，基因重复在生命演化过程中所扮演的重要角色逐渐被广泛认知。基因重复是新基因的主要起源机制之一,贡献了真核生物基因组中约一半的基因。近20年来，组学技术的进步使得领域内对重复基
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摘要：大数据和人工智能（AI）的突破性进展正在深刻改变科学研究的范式。“相关性取代因果关系”的范式备受争议，而“数据密集型科学发现”范式逐渐成为主流。随着AI技术的持续成熟，“机器人科学家”范式正在逐步成为现实。该范式意味着AI能够自主完成科学研究的每一个步骤。 目前新一代通用人工智能（AGI）算法则有望
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摘要：生命是一种语言，基因组语言模型（gLMs）旨在捕捉DNA的复杂"语法"。今日小编分享一篇来自加州大学伯克利分校发表的预印版综述文章：Genomic Language Models: Opportunities and Challenges。希望对你有所启发。 DNA语言模型应用潜力 本质上，gLMs
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摘要：棉花产量与纤维品质如何受到DNA甲基化调控？在人工智能（AI）的帮助下，中国棉花育种专家成功破译这一“密码本”，并从中找出有望改良棉花品种的关键基因位点。 近日，由浙江大学棉花精准育种团队、中国农业科学院生物技术研究所和湖畔实验室智慧育种团队组成的联合科研团队，综合运用遗传学、生物大数据和AI技术，
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摘要：葡萄是一种具有重要经济价值的多年生水果作物，可作为水果食用或作为酿造葡萄酒的原材料，已有逾万年的驯化历史[1]，并且在驯化过程中积累了大量的有害突变[1-3]。由于育种周期长，育种性状的遗传学研究不深入，遗传转化体系不成熟，尚未广泛应用多组学与人工智能等革命性技术，葡萄的生物育种体系明显滞后于一年生
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摘要：近日，华中农大玉米李林教授团队联合西北农林朱万超副教授、中国农科院作科所张红伟研究员，在JIPB在线发表了题为 “Big data and artificial intelligence–aided crop breeding: Progress and prospects” 的特约综述文章。 ht
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摘要：分享一篇2023年7月25日发表在Molecular Plant上的一篇综述文章：“Plant genome resequencing and population genomics: Current status and future prospects”，总结了植物基于群体的基因组重测序研究的进
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摘要：植物育种历经数千年演变，从古代的基础选择策略发展到如今的育种4.0阶段，旨在增强作物多样性和保障粮食安全。面对气候变化、人口增长和耕地有限等挑战，人工智能（AI）成为关键解决方案。本综述探讨了植物育种的历史进程，阐述了AI在作物改良各方面的应用及其重要作用，强调了其对培育适应全球粮食安全挑战的作物品
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摘要：2024年7月，美国丹佛斯植物科学中心的Katherine M. Murphy等人在Annual Review of Plant Biology发表了题为 Deep Learning in Image-Based Plant Phenotyping 的文章，综述了深度学习技术在植物表型分析中的应用。
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摘要：2024年7月，Genomics, Proteomics & Bioinformatics （GPB）在线发表了由中国农业大学王向峰教授团队撰写的题为“Machine learning for AI breeding in plants”的观点文章。 机器学习 （ML） 使人工智能 （AI） 变得智
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摘要：近日，中国热带农业科学院/热带生物技术研究所甘蔗研究中心在“国家热带农业科学中心科技创新团队”和“热带作物生物育种全国重点实验室科研项目”等专项资助下，研究并发布了甘蔗智慧育种的全新架构。相关研究成果以_Digital evolution and twin miracle of sugarcane
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摘要：在玉米从其祖先大刍草驯化而来的8000至10000年历史中，其株型和穗型经历了显著的演变。尽管株型和穗型分别与营养器官和生殖器官相关，但它们在发育过程中有着紧密的联系和共同的遗传基础。尽管已知几个关键基因如_tb1、tga1、tru1、gt1_在玉米驯化中起作用，但这些基因如何协同调控株型和穗型的变
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摘要：近年来，大语言模型（LLMs）已在自然语言、计算机视觉等通用领域引发了新一轮技术革命，通过大规模语料和模型参数进行预训练，LLMs能够掌握语言的共性规律，能够对多种下游任务产生质的提升，已经形成了新的人工智能范式。在生命科学领域，单细胞组学技术的突破产生了大量不同物种细胞的基因表达谱数据，形成了海量
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摘要：导读：七月份，李恒开发的基因内容图谱构建软件——Pangene，以标题为：Exploring gene content with pangene graphs 的论文论文形式一并发表，发表期刊为Bioinformatics杂志。该软件迎合了群体基因组学时代数据井喷的现状，而一定程度上分析工具和软件算
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