随笔分类 - 文献
摘要：分享一篇近期发表在Nature Plants上题为“The future of genome editing in plants”的评论文章，这篇文章探讨了植物基因组编辑技术的未来发展方向，强调基因组编辑技术将超越目前简单的单核苷酸多态性和短缺失，转向模拟自然进化过程中塑造植物基因组的大型结构变异（
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摘要：NORG形成和片段化的机制总结。 一般认为，植物细胞中的叶绿体和线粒体起源于原始蓝细菌和ɑ-变形菌，是真核细胞中拥有少量基因组的半自主性细胞器。目前已经在现存的包括水稻在内的许多真核生物中发现线粒体DNA（mitochondrial DNA, mtDNA）和叶绿体DNA（plastid DNA, p
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摘要：2025年4月28日，阿卜杜拉国王科技大学Rod A. Wing教授在Nature Genetics发表研究论文：Oryza genome evolution through a tetraploid lens。 背景 • 稻属（Oryza）包含27个物种和11种基因组类型，基因组大小差异约3.4倍
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摘要：2025年4月8日，中国科学院遗传发育所王冰研究员和崖州湾国家实验室/遗传发育所李家洋院士团队提出“甘蔗理想株型”创新理念，阐述其塑造过程中面临的挑战、机遇及关键育种策略，为实现甘蔗产量突破提供了新思路，对保障全球糖料安全具有重要意义。该观点论文以“Shaping Future Sugarcane:
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摘要：2025年3月18日，山东农业大学李传友教授团队、中国农业大学杜敏敏教授团队和北京市农林科学院蔬菜所李常保研究员团队等在JIPB发表了题为“Molecular Breeding of Tomato: Advances and Challenges”的特邀综述论文 (https://doi.org/1
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摘要：点击蓝字 关注我们 短串联重复序列(STRs)是由1-6 bp重复基序组成的多态性DNA序列，广泛分布于真核生物基因组中。近年来研究表明，STRs不仅在基因表达调控和表型变异中发挥重要作用，还与多种人类遗传疾病密切相关。例如，2023年12月，_JGG_报道了长非编码RNA的CGG重复扩增导致眼咽远
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摘要：背景（Background） 1.研究目的： 水稻作为重要粮食作物，提高产量和品质至关重要。全基因组关联研究（GWAS）是挖掘复杂农艺性状相关基因的主要方法，但其受限于群体结构、样本量和低频变异检测能力。Meta分析通过整合多个独立GWAS结果，可扩大样本量、提高检测效力，但在水稻中的应用有限。 2
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摘要：分享一篇水稻公共数据挖掘文章。 直接用AI阅读吧。 最近试了下腾讯元宝，感觉总体还不错，包括总结、精读、翻译和脑图等四部分。 扩展阅读：近40年中国杂交稻品质性状演变规律
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摘要：小麦是全球最重要的粮食作物之一，养育着世界众多人口。随着人口增长和气候变化，培育高产、稳产、抗逆的小麦品种对于保障粮食安全至关重要。近年来，小麦基因组学研究取得了突破性进展，为小麦遗传改良和育种创新提供了前所未有的机遇。 马里兰大学的Vijay K. Tiwari（通讯作者）团队在 Trends i
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摘要：高通量表型组和基因组的关联，这种学科交叉性的研究是比较好出文章的，比如华农杨万能老师等早就在水稻发表过类似，但这涉及到不同课题组的联合研究，毕竟术业有专攻，各有所长。 今天分享一篇来自Plant Phenomics的棉花研究。 棉花作为全球最重要的天然纤维作物之一，其重要农艺性状的功能基因组研究
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摘要：植物界中存在超过二十万种代谢物，这些化合物不仅对植物的生长发育和抗逆抗病具有重要作用，还蕴含着丰富的营养与药用价值。得益于色谱、质谱技术及代谢组学分析策略的发展，目前已有能力同时检测数千种植物代谢物。然而，传统基于色谱-质谱联用的检测方法存在样品制备繁琐、耗时长、成本高等局限性，严重制约了代谢组学技
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摘要：2025年3月7日，山东农业大学、中国农业科学院作物科学研究所小麦品质研究与新品种选育团队与CIMMYT合作，在《Molecular Plant》发表题为“Mobilizing Triticeae diversity from Genebanks to farmer’s field”的短评，系统总结
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摘要：近日，华南农业大学作为国内唯一通讯单位的国际大科学计划FarmGTEx(农业动物基因型-组织表达项目，The Farm Animal Genotype-Tissue Expression Project)白皮书以Perspective文章的形式在Nature Genetics发表。 FarmGTEx
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摘要：文章标题 SPDC-HG: An accelerator of genomic hybrid breeding in maize 背景 玉米是全球最重要的粮食、饲料和生物能源作物之一，杂交育种是提高玉米产量潜力的最有效策略。自20世纪60年代以来，通过不同杂种优势群（heterotic groups
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摘要：介绍近期ICRISAT发表的一篇关于复杂植物泛基因组研究的综述：Developing pangenomes for large and complex plant genomes and their representation formats。这篇文章主要探讨了植物泛基因组（pangenome）的
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摘要：背景 2025年3月6日，中国农业科学院作物科学研究所作物智能设计算法模型创新研究组成功研发了一套自动化机器学习框架，通过将气象环境大数据与基因组信息深度融合，实现了作物精准遗传分析与基因组预测，为作物智能设计育种提供有效工具。相关研究成果发表在《Advanced Science》上。 本文研究的核
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摘要：背景 玉米（Zea mays L.）是全球三大主要粮食作物之一，其产量的提升主要归功于杂种优势。传统的玉米杂交种选育依赖于多环境测试和育种者的经验，这种方法耗时且成本高昂。随着全球气候的变化，开发适应不同环境的高产玉米种质变得尤为重要。基因组选择（Genomic Selection, GS）作为一种
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摘要：葡萄（Vitis）在全球范围种植广泛，即可鲜食又可加工成葡萄酒等，具有很高的经济价值，是农民致富、乡村振兴、人民美好生活中不可或缺的重要园艺作物。葡萄属于葡萄科葡萄属植物，该属包括两个亚属，麝香葡萄亚属(Muscadinia Planch)和真葡萄亚属(Euvitis Planch），共计70余个种
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摘要：近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所刘毓文课题组与广西大学赵云翔课题组合作，在基因组育种共性技术领域取得了重要创新性突破。相关研究成果以《DPImpute: A Genotype Imputation Framework for Ultra-low Coverage Whole-genome S
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摘要：2025年1月28日，海南大学南繁学院夏志强团队与桂林市农业科学研究中心联合在《Agronomy》发表研究：Assessment of the Prediction Accuracy of Genomic Selection for Rice Amylose Content and Gel Cons
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