随笔分类 - 文献
摘要：高通量表型组和基因组的关联，这种学科交叉性的研究是比较好出文章的，比如华农杨万能老师等早就在水稻发表过类似，但这涉及到不同课题组的联合研究，毕竟术业有专攻，各有所长。 今天分享一篇来自Plant Phenomics的棉花研究。 棉花作为全球最重要的天然纤维作物之一，其重要农艺性状的功能基因组研究
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摘要：植物界中存在超过二十万种代谢物，这些化合物不仅对植物的生长发育和抗逆抗病具有重要作用，还蕴含着丰富的营养与药用价值。得益于色谱、质谱技术及代谢组学分析策略的发展，目前已有能力同时检测数千种植物代谢物。然而，传统基于色谱-质谱联用的检测方法存在样品制备繁琐、耗时长、成本高等局限性，严重制约了代谢组学技
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摘要：2025年3月7日，山东农业大学、中国农业科学院作物科学研究所小麦品质研究与新品种选育团队与CIMMYT合作，在《Molecular Plant》发表题为“Mobilizing Triticeae diversity from Genebanks to farmer’s field”的短评，系统总结
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摘要：近日，华南农业大学作为国内唯一通讯单位的国际大科学计划FarmGTEx(农业动物基因型-组织表达项目，The Farm Animal Genotype-Tissue Expression Project)白皮书以Perspective文章的形式在Nature Genetics发表。 FarmGTEx
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摘要：文章标题 SPDC-HG: An accelerator of genomic hybrid breeding in maize 背景 玉米是全球最重要的粮食、饲料和生物能源作物之一，杂交育种是提高玉米产量潜力的最有效策略。自20世纪60年代以来，通过不同杂种优势群（heterotic groups
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摘要：介绍近期ICRISAT发表的一篇关于复杂植物泛基因组研究的综述：Developing pangenomes for large and complex plant genomes and their representation formats。这篇文章主要探讨了植物泛基因组（pangenome）的
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摘要：背景 2025年3月6日，中国农业科学院作物科学研究所作物智能设计算法模型创新研究组成功研发了一套自动化机器学习框架，通过将气象环境大数据与基因组信息深度融合，实现了作物精准遗传分析与基因组预测，为作物智能设计育种提供有效工具。相关研究成果发表在《Advanced Science》上。 本文研究的核
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摘要：背景 玉米（Zea mays L.）是全球三大主要粮食作物之一，其产量的提升主要归功于杂种优势。传统的玉米杂交种选育依赖于多环境测试和育种者的经验，这种方法耗时且成本高昂。随着全球气候的变化，开发适应不同环境的高产玉米种质变得尤为重要。基因组选择（Genomic Selection, GS）作为一种
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摘要：葡萄（Vitis）在全球范围种植广泛，即可鲜食又可加工成葡萄酒等，具有很高的经济价值，是农民致富、乡村振兴、人民美好生活中不可或缺的重要园艺作物。葡萄属于葡萄科葡萄属植物，该属包括两个亚属，麝香葡萄亚属(Muscadinia Planch)和真葡萄亚属(Euvitis Planch），共计70余个种
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摘要：近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所刘毓文课题组与广西大学赵云翔课题组合作，在基因组育种共性技术领域取得了重要创新性突破。相关研究成果以《DPImpute: A Genotype Imputation Framework for Ultra-low Coverage Whole-genome S
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摘要：2025年1月28日，海南大学南繁学院夏志强团队与桂林市农业科学研究中心联合在《Agronomy》发表研究：Assessment of the Prediction Accuracy of Genomic Selection for Rice Amylose Content and Gel Cons
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摘要：基因组选择（Genomic Selection, GS）是一种新兴的植物育种策略，通过高密度分子标记预测目标性状的育种值，从而加速育种进程并降低成本。然而，传统方法在预测复杂性状时存在局限性，因为它们无法充分反映基因型与表型之间复杂的非线性关系。近年来，深度学习（Deep Learning, DL）
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摘要：点击蓝字 关注我们 大豆作为全球食品安全的重要基础，是人类日常生活中高质量植物蛋白质和油脂的重要来源。大豆种质资源丰富，蕴含着宝贵的遗传资源，为育种提供了巨大潜力。多组学技术的发展极大推动了大豆遗传资源的发掘，为精准育种和品种改良提供了强有力支持。 2025年2月19日，Journal of Gen
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摘要：英国詹姆斯·赫顿研究所（James Hutton Institute）Robbie Waugh教授领衔，张润烜博士、过文彬博士团队联合包括澳大利亚默多克大学李承道教授团队、浙江大学张国平教授团队等多家国际研究机构，在Nature Genetics发表了题为_A barley pan-transcri
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摘要：▼ 大豆品种的快速精准分类对质量控制和农业生产具有重要意义。基于高光谱成像的深度学习模型能够有效的对大豆种子进行品种分类，但是当前的种子品种分类深度学习模型未能有效结合局部与全局空间特征，且对小样本数据的适应能力较弱，限制了其实用性。 近日，黑龙江大学联合中国农业科学院作物科学研究所在The Cro
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摘要：近期，Molecular Plant杂志发表了玉米、小麦、大豆、棉花、大麦、苜蓿等六大作物的研究综述以及未来（2035）育种展望。 （公众号后台回复：作物2035，领取pdf文献。） 小编利用阿里云百炼平台的Qwen-Long（长下文模型，需要付费哦，测试的话100万token免费试下），基于上述p
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摘要：最近读到的马铃薯相关的研究和文章越来越多了。当然，黄院士的“优薯计划”影响力功不可没。 （点击下方各标题链接，详细阅读） PBJ | 利用PanTools构建马铃薯单倍体泛基因组 2025年1月5日，荷兰瓦赫宁根大学科研人员在PBJ在线发表“Exploring intra- and intergen
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摘要：Abstract 摘 要 2025年1月28日，华中农业大学玉米团队在Molecular Plant上发表了题为“GEFormer: a Genomic Prediction Method of Genotype-Environment Interaction in Maize by Integra
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摘要：▼ 计算机仿真模拟能够有效地利用育种大数据以及大量的遗传信息，在育种家开展田间试验之前对育种程序中的各种因素进行模拟筛选和优化，提出最佳的亲本组配方案和后代选择方法，提高育种过程中的预见性。模拟预测既是科学研究的重要手段，也是科学化预测和决策的重要方法，而仿真模拟计算机工具研发则是开展育种模拟和预测
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摘要：最近读到的马铃薯相关的研究和文章越来越多了。当然，黄院士的“优薯计划”影响力功不可没。 （点击下方各标题链接，详细阅读） PBJ | 利用PanTools构建马铃薯单倍体泛基因组 2025年1月5日，荷兰瓦赫宁根大学科研人员在PBJ在线发表“Exploring intra- and intergen
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