随笔分类 - 文献
摘要：今年4月，华中农业大学焦文标团队在Genome Biology上发表论文：A comprehensive benchmark of graph‑based genetic variant genotyping algorithms on plant genomes for creating an a
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摘要：近日，中国农科院植保所联合扬州大学、湖南农大等在中国工程院主刊 Engineering （一区top, IF=12.8）上发表了题为《Development of Machine Learning Methods for Accurate Prediction of Plant Disease Re
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摘要：本文来自CABI的一篇综述要点。文章探讨了通过选择、杂交、诱变和重组实现的新的遗传变异性，以及植物育种技术创新如何为作物改良提供更精准和更高分辨率的方法。 引言 随着全球人口的增长和气候变化带来的挑战，粮食安全成为全球关注的重点。预计到 2050 年，世界人口将达到 100 亿，这要求我们不仅要养活
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摘要：分享来自张学勇老师的一篇综述。 遗传多样性是一个物种在自然界生存的基础，也是作物遗传改良的基石。经过近100年的考察、收集、评价、编目、入库，全球收集种质资源约740万份，存放在1750个种质库中；我国收集各类作物种质资源总量达50万份。丰富的资源一方面为作物改良奠定了基础，另一方面也带来了困扰，即
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摘要：北京市农林科学院信息技术研究中心赵春江院士团队联合华中农业大学杨万能教授团队发布在PBJ上的综述文章：Plant microphenotype: from innovative imaging to computational analysis，深入探讨了植物微观表型（microphenotype）
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摘要：分享一篇水稻种质资源创新研究与利用的相关综述，内容比较全面，包括了我国水稻种质资源收集、评价与精确鉴定、水稻新品系创制、水稻杂种优势利用、水稻种质创制新技术、新方法以及水稻优异基因资源的挖掘与利用等方面。 截止到2023 年，我国保存的作物种质资源有超过54 万份，其中有8 万多份是水稻种质资源，数
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摘要：本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具，并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。 水稻基因组数据库 水稻转录和转录后调控数据库 水稻基因网络数据库 水稻种质资源信息数据库 水稻常用的基因编辑系统 水稻基因编辑生物信息工具与数据库 水稻智能育种生物信息工具 专家简介:
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摘要：品种是玉米高产的基础，进一步提高品种耐密性和种植密度是提高玉米单产的关键。 在近80 年中，美国玉米单产提升了近8 倍，这个过程中种植密度从平均每亩2000 多株增加到近6000 株，种植密度贡献显著。 我国高产玉米新品种更新迭代过程中，玉米株型也逐渐从平展型演变成紧凑型，品种的耐密性明显提高，但和
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摘要：近日，《生物技术通报》特邀浙江大学农业与生物技术学院陈露研究员（原严建兵老师学生）团队发表综述《玉米野生种基因组研究进展及应用》。本文主要综述了大刍草的基因组进化、数量遗传学、群体遗传学等方面的研究进展，同时对大刍草在未来玉米遗传育种中的应用进行了展望。 玉米的野生近缘种，被统称为大刍草（teosi
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摘要：近日，《生物技术通报》特邀扬州大学农学院徐辰武教授团队发表综述《作物全基因组选择育种技术研究进展》。本文首先分析了影响作物GS功效的主要因素，继而从非加性效应模型、群体构建方案、多性状与多环境预测、多组学预测和育种芯片技术现状等方面阐述了GS技术在作物育种中的研究进展，并指出研究所面临的问题和发展前
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摘要：基因组选择（GS）被认为是加速优良基因型评估和选择的关键方法，可以在传统育种中实施。GS通过基因组预测（GP）模型预测目标性状的基因型值，并在育种方案中使用这些预测值进行选择。GS实现了基于预测基因型值的个体选择和杂交选择，减少了目标性状的田间评估次数，从而实现高效快速的育种。然而，GS本身并不旨在
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摘要：尽管基因组预测的育种值通常是基于各种统计方法计算的，如基因组最佳线性无偏预测（GBLUP）、贝叶斯回归模型等，但这些方法通常假设复杂性状受许多微效基因影响，且基因型和表型之间的关系是线性的。虽然有效，但线性假设可能限制了它们在全基因组预测上的表现。 机器学习模型的发展允许进行高维非线性回归，有效捕捉
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摘要：近期，安徽农业大学信息与人工智能学院在期刊 npj | systems biology and applications 上发表论文：Crop-GPA: an integrated platform of crop gene-phenotype associations。提出了Crop-GPA（ h
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摘要：近期，瑞典Rodomiro Ortiz团队在Molecular Plant发表综述：Genomic selection in plant breeding: Key factors shaping two decades of progress，总结了近20年植物基因组选择育种的影响因素和重要进展。
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摘要：近期，华中农大严建兵团队在Journal of Genetics and Genomics上发表综述：Engineering the future cereal crops with big biological data: towards an intelligence-driven breedi
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摘要：油菜综述刚发JIPB（往期：），又见Plant Com，同一家单位同一作物连综述内容都及其相似，这么严重的撞车还能接连发不同的国产期刊，也是少见。 近日，华中农大刘克德&洪登峰团队在Plant Communications上发表了综述：The story of a decade: genomics,
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摘要：近期，华中农大赵虎&郭亮团队在JIPB上发表发表综述：Functional genomics of Brassica napus: Progresses, challenges and perspectives，总结了近年来油菜功能基因组学的研究进展，包括种质资源、组学数据库和克隆功能基因的可用性以
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摘要：近日，Wing-Kin Sung(宋永健)博士在Nature Methods发文Creating diploid assemblies from Nanopore and Illumina reads with hypo-assembler，报道其开发的基因组组装新工具hypo-assembler，
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摘要：摘要：为探究我国智慧农业未来发展的目标、任务与政策，本文基于系统工程学视角，阐释了智慧农业的概念与内涵，介绍了国外智慧农业相关战略布局与行动计划，分析了我国智慧农业发展现状、特点以及与国际上的差距，提出了我国智慧农业未来发展目标、重点任务与政策建议。美、德、英、日等国在农业传感器、农业大数据智能、农
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摘要：分享一篇近期来自华中农大王旭彤老师（即SoyDNGP作者）的综述，以SoyDNGP为例。建议参考之前的推文：基于深度学习框架的基因组预测新模型SoyDNGP。 摘要 人工智能（AI）与作物育种的结合代表了向数据驱动型农业实践的范式转变，旨在提高作物改良的效率和精度。本文对大豆深度神经网络等基因组预测
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