小鲨鱼2018

2025年4月23日

摘要： centos7 中编译安装 MSMC2软件 001、下载安装包： https://github.com/stschiff/msmc2/archive/refs/tags/v2.1.4.tar.gz 002、解压安装 tar -xzvf v2.1.4.tar.gz cd msmc2-2.1.4/ 00 阅读全文

posted @ 2025-04-23 18:11 小鲨鱼2018 阅读(38) 评论(0) 推荐(0)

非root用户安装、配置gsl环境变量

摘要： 001、非root用户安装、配置gsl环境变量，编译软件环境报错如下： 002、非root用户安装gsl a、下载地址 http://mirrors.ustc.edu.cn/gnu/gsl/gsl-2.5.tar.gz b、编译安装 tar -xzvf gsl-2.5.tar.gz cd gsl-2 阅读全文

posted @ 2025-04-23 17:25 小鲨鱼2018 阅读(51) 评论(0) 推荐(0)

msmc2软件conda安装

摘要： 001、 conda install msmc2 -c bioconda 。阅读全文

posted @ 2025-04-23 16:27 小鲨鱼2018 阅读(30) 评论(0) 推荐(0)

centos7中 rpm -qa 命令

摘要： 001、rpm：redhat package manager： -q：query a：all rpm -qa：列出所有的已经安装的包。 002、等价于：yum list installed 阅读全文

posted @ 2025-04-23 15:36 小鲨鱼2018 阅读(90) 评论(0) 推荐(0)

centos7 中root用户 libgsl库的安装

摘要： 001、 cc: 错误：/usr/local/lib/libgsl.a：没有那个文件或目录 002、下载：http://mirrors.ustc.edu.cn/gnu/gsl/gsl-2.5.tar.gz 003、解压： tar -xzvf gsl-2.5.tar.gz cd gsl-2.5/ ./ 阅读全文

posted @ 2025-04-23 15:17 小鲨鱼2018 阅读(66) 评论(0) 推荐(0)

tar.xz 后缀文件如何解压

摘要： 001、 tar.xz 后缀文件如何解压： tar -xvf dmd.2.111.0.linux.tar.xz ## 保留原始安装包阅读全文

posted @ 2025-04-23 15:05 小鲨鱼2018 阅读(18) 评论(0) 推荐(0)

2025年4月22日

R语言实现矩阵形式于三列表形式的相互转换

摘要： R语言实现矩阵形式于三列表形式的相互转换。阅读全文

posted @ 2025-04-22 20:53 小鲨鱼2018 阅读(8) 评论(0) 推荐(0)

R语言、python实现fst值滑窗和步长的计算

摘要： R语言、python实现fst值滑窗和步长的计算。 001、R语言版本 dir() # 读取数据（按实际文件路径修改） fst_data <- read.table("GMM_SUM.fst", header = T) head(fst_data) colnames(fst_data) <- c(" 阅读全文

posted @ 2025-04-22 20:53 小鲨鱼2018 阅读(52) 评论(0) 推荐(0)

linux中如何实现删除每行匹配的最后一个指定的字符之后即之前的内容

摘要： 001、删除每一行最后一个匹配的特定字符后边的部分 [root@localhost test]# ls a.txt [root@localhost test]# cat a.txt ## 测试数据 ab ad aj di ii rr [root@localhost test]# sed 's/\( 阅读全文

posted @ 2025-04-22 20:46 小鲨鱼2018 阅读(53) 评论(0) 推荐(0)

Linux 中如何实现将每一行最后一个匹配的指定字符替换为特定的字符

摘要： 001、 [root@localhost test]# ls a.txt [root@localhost test]# cat a.txt ## 测试数据 ab ad aj dd ii rr [root@localhost test]# sed 's/\(.*\)a/\1Q/' a.txt ## 将阅读全文

posted @ 2025-04-22 20:39 小鲨鱼2018 阅读(24) 评论(0) 推荐(0)

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