随笔分类 - 生信
摘要：001、问题configure: error: libbzip2 development files not found 002、解决方法： apt-get install libbz2-dev 参考：https://www.yisu.com/ask/5621.html
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摘要：001、问题：configure: error: curses development files not found 002、解决方法: apt-get install libncurses5-dev 参考：https://blog.csdn.net/cw616729/article/detail
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摘要：001、问题：configure: error: zlib development files not found 002、解决方法： apt install zlib1g apt install zlib1g-dev 参考：https://www.gylmap.com/110743.html
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摘要：001、问题 configure: WARNING: S3 support not enabled: requires SSL development files 002、解决方法 apt-get install apache2 apt-get install libssl-dev 参考：https
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摘要：001、问题 002、解决方法 apt-get install libcurl4-openssl-dev 参考：https://www.manongdao.com/article-2248882.html
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摘要：001、问题 002、解决方法 root@ubuntu01:/home/software/htscodecs# apt-get install libtool 003、再次执行 root@ubuntu01:/home/software/htscodecs# autoreconf -i 参考：http
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摘要：001、问题 root@ubuntu01:/home/software/htslib# ./configure ## 编译软件时出现如下报错 002、解决方法 root@ubuntu01:/home/software/htslib# apt install liblzma-dev 参考：https:
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摘要：001、问题 root@ubuntu01:/home/software/htslib# ./configure ## 编译软件，出现如下问题 002、解决方法 root@ubuntu01:/home/software/htslib# apt install libbz2-dev 参考：https:/
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摘要：001、问题 root@ubuntu01:/home/software# git clone https://github.com/samtools/htslib Cloning into 'htslib'... fatal: unable to access 'https://github.com
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摘要：001、问题 root@ubuntu01:/home/software/PopIns2/PopIns2# ./popins2 ./popins2: error while loading shared libraries: libbifrost.so: cannot open shared obje
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摘要：https://blog.csdn.net/weixin_44031582/article/details/122604217
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摘要：001、问题 git clone时出现如下问题 fatal: unable to access 'https://github.com/GATB/gatb-minia-pipeline/': GnuT 002、解决方法 root@ubuntu01:/home/software/gatb# vim ~
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摘要：001、 双端测序下机数据中得到的read1和read2是两条互补链insertsize中方向相对的两条序列，再比对到单链的参考基因组之前会先将其中一条read转义，然后进行比对，所以比对得到的SAM和BAM文件中read1和read2有一条是被转了的。 来源：https://www.jianshu
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摘要：前期分析参考：https://www.jianshu.com/p/4f7aeae81ef1 001、 library(dplyr) library(Seurat) library(patchwork) pbmc.data <- Read10X(data.dir = "C:/Users/75377/D
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摘要：前期参考：https://www.jianshu.com/p/4f7aeae81ef1 001、 library(dplyr) library(Seurat) library(patchwork) pbmc.data <- Read10X(data.dir = "C:/Users/75377/Des
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摘要：001、plink软件生成raw文件 root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped ## maf过滤，并将基因型数据转换为0、1、2的形式 root@PC1:/home/test# plink --file outcome --sheep --maf
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摘要：001、 root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# cat outcome.map ## 测试数据，均为24号染色体数据 24 snp1 0 260996 24 snp2 0 363750 24 snp3
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摘要：001、 root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# cat outcome.map ## 测试数据map文件 20 OAR20_27119.1 0 217914 20 OAR20_192404.1 0 3
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摘要：001、 所谓Phasing就是要把一个二倍体基因组上的等位基因，按照其亲本正确地定位到父亲或者母亲的染色体上，最终使得所有来自同一个亲本的等位基因都能够排列在同一条染色体里面。 来源：https://www.jianshu.com/p/a30de54b83c3
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摘要：上游分析：https://www.jianshu.com/p/4f7aeae81ef1 001、 cell <- pbmc[["pca"]]@cell.embeddings cell <- cell[order(cell[,1], decreasing = T),] cell <- rownames
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