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摘要： P122, 这是IQR method课的第一次作业，需要统计检验，x和y是否显著的有线性关系。 入门：散点图、线性拟合、拟合参数slope 进阶：统计检验，多重矫正FDR 基本概念： 这和基本的代数一样，只是统计更加严谨，把误差纳入到模型中了。 怎么估计A和B呢？ A和B可以看做是群体的参数，a和b 阅读全文

摘要： 刚看完F1巴林站比赛，23点到1点，整整两个小时，比赛相当精彩。 从排位赛结果看，法拉利似乎肯定包揽1-2名，可惜天公不作美，今晚风大、沙多；vettel自己失误，鼻翼掉了，还在被汉密尔顿超车的时候自己打滑，直接跌出了前4； 勒克莱尔更是乐极生悲，50几圈的时候涡轮爆了，每圈就慢了5秒，直接被梅奔两 阅读全文

摘要： 参考：GT sport所有赛道简介 今天的心情变化挺大，从绝望放弃到豁然开朗。 前言：GT sport有个排位赛，是每位sim赛车手提升自己等级的唯一途径，其中一个排位赛就是龙之径II（逆时针跑），我跑了大概有两天，都没有什么收获，一度觉得自己真的没有什么赛车天赋，绝望到想删游戏。 因为已经参加过几 阅读全文

摘要： 模拟真实的生物系统，从有机分子到细胞，到组织，到器官，到个体，到家系，到群体。 正确的设计结构，可拓展性，可塑性。 良好的可视化。 面向对象的编程，游戏引擎。 基因结构class 细胞结构class 组织结构class 个体结构class 我们都是被实例出来的某个类地一个对象。 真正的个性化医疗的最 阅读全文

摘要： 问题： 为什么组间方差加组内方差一定等于总方差？如何从数学上理解。PPT里有证明，引入一个中间项就行。 方差分析、协方差分析和回归分析有什么联系？ 什么是F分布？Fisher的独创，理解不了F分布就不可能真正理解方差分析。 方差分析，就是要分析方差的来源！ 我们把组内方差看做是随机误差；组间差组成比 阅读全文

摘要： 参考：GT sport所有赛道简介 GT Sport - Tip/Guide For FASTER LAP TIMES (Brands Hatch) 赛道介绍、跑法、赛事网上都有大把的视频。 GT sport里的实存赛道，最有名的应该是Nürburgring纽博格林了，这次要分析的是伯蘭士赫治赛道， 阅读全文

摘要： sorry，玩了几天的GT sport才发现赛车有多难，理论的最佳走线是存在的，但是真实的赛道实在是千变万化，弯道形状角度、高低差、F1还有温度和风速，甚至是路面上的一个碎石都会极大地影响你的成绩。赛车的不确定性太大，玩了这么几天发现，只有提高自己的技艺才能减少这种不确定性。极限是存在的，如何控制住 阅读全文

摘要： 2019年03月15日 这两天MBBS监考，为了克服无聊，在监考期间开始了踱步漫想，整理脑中的碎片知识，再次深刻理解了孔夫子的那句话：学而不思则罔，思而不学则殆。 大学硕士博士期间都学过统计，但总感觉统计十分陌生，自认为根本就不理解统计的精髓，一旦到了应用时，心理就犯怯。理解不深主要是学和思都不够。 阅读全文

摘要： 转自：http://www.matrix67.com/blog/archives/105 这或许是众多OIer最大的误区之一。 你会经常看到网上出现“这怎么做，这不是NP问题吗”、“这个只有搜了，这已经被证明是NP问题了”之类的话。你要知道，大多数人此时所说的NP问题其实都是指的NPC问题。他们没有 阅读全文

摘要： paper：A Complete Electron Microscopy Volume of the Brain of Adult Drosophila melanogaster 果蝇是一个非常完美的研究大脑的模式动物，10万级的神经元却已经形成了较为复杂的智能行为，这远比直接研究1000亿级的人类 阅读全文

摘要： Chen, H., Li, C., Peng, X., Zhou, Z., Weinstein, J.N., Liang, H. and Cancer Genome Atlas Research Network, 2018. A Pan-Cancer Analysis of Enhancer Exp 阅读全文

摘要： RNA-seq这个工具该什么时候用？ATAC-seq该什么时候用？有相当一部分项目设计不行，导致花大钱测了一些没有意义的数据。 还是在中心法则这个框架下来解释，这是生物信息的核心。打开华大科技服务官网梳理一下现在到底都有些什么测序技术： 全基因组测序和重测序 - 组装以及寻找变异 （外显子和目标区域 阅读全文

摘要： R批量做GSEA分析还没有官方的包，但是clusterprofiler可以做，它调用了最新的gfsea包。Gene Set Testing for RNA-seq - fgsea教程 RNA-seq是利器，大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据，所以RNA-seq的分析需求应该是很大的（大部分的生 阅读全文

摘要： 有些讲得太烂了，我来通俗的梳理一下R2. Calculating R-squared 在线性回归的模型下，我们可以计算SE(line), SE(y均值)。 The statistic R2describes the proportion of variance in the response var 阅读全文

摘要： 起源：协方差自然是由方差衍生而来的，方差反应的是一个变量（一维）的离散程度，到二维了，我们可以对每个维度求其离散程度，但我们还想知道更多。我们想知道两个维度（变量）之间的关系，直观的举例就是身高和体重（青少年），我们采集到的数据里面有一种固有的性质，那就是身高越高的样本似乎总有着更大的体重，那我们如 阅读全文

摘要： 转自：https://blog.csdn.net/Meditator_hkx/article/details/52823936 序言自从选择了直博这条路，前前后后也看了有二十余篇文献，自己做的毕业设计也算是一个中型的论文，所以对于科研也可以说是稍微有点眉目了吧。 而我相信，每一个研究生（无论博士还是 阅读全文

摘要： 来自英语课的一个练习： https://www.youtube.com/watch?v=ePY3uY1L0X0 next up I'd like to welcome Joshua to ten he's from the ANU College of Medicine biology and th 阅读全文

摘要： 貌似可以随机读取dataframe格式的文本文件。 阅读全文

摘要： 单细胞转录组确实是利器，但我们大多只利用了表达的信息，而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。 最近nature发了一篇单细胞方法类文章，讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。 velocyto velocyto-notebooks RNA velocity of 阅读全文

摘要： Dynamic networks reveal key players in aging 系统生物学中的网络分析 网络的拓扑结构：topological properties， 网络的度：whole network connectivity (degree)，节点度是指和该节点相关联的边的条数，又称 阅读全文