2019年4月17日
Prim算法、Kruskal算法和最小生成树 | Minimum Spanning Tree
摘要： graph to tree非常有趣！ 距离的度量会极大地影响后续的分析，欧式距离会放大差异，相关性会缩小差异，导致某些细胞群分不开。 先直观看一下，第一个是Prim，第二个是Kruskal。但是肯定都是有局限性的！我也在尝试新的方法，提升表现。 先看看算法的差异： 参考： 话说最小生成树的prim算 阅读全文
posted @ 2019-04-17 18:08 Life·Intelligence 阅读(437) 评论(0) 推荐(0)
HOMER | MEME | 转录因子的靶基因预测 | motif富集分析
摘要： 2025年04月18日 homer出新功能了，能够根据你的目标序列生成background control，这个在motif这种假阳性极高的分析里至关重要。 conda install bioconda::homer=5.1 homer2 background -p DMSO_SOX9.29024. 阅读全文
posted @ 2019-04-17 12:49 Life·Intelligence 阅读(29987) 评论(0) 推荐(0)
TOP