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摘要： 现在在做单基因敲除后的转录组数据分析，一个显而易见却又百思不得其解的问题出现了： 为什么敲掉一个基因会导致其他那么多基因的表达发生了变化，甚至是其他很多调控基因（转录因子）？ 我敲掉的只是一个普通基因，又不是上游的调控基因，理论上应该只有该基因和与其直接相关的基因改变才对啊。 Genome-wide 阅读全文

摘要： Dr. Andrew Paul HutchinsDepartment of BiologySouthern University of Science and Technology, Shenzhen, China Every cell contains all of the DNA to enco 阅读全文

摘要： 现在大家已经对细胞结构单位习以为常，但在细胞发现之前，这是不可思议的，千奇百怪的生命世界居然有一个统一的基本单位。 这里简单回忆一下经典的细胞结构： 参考YouTube视频： Biology: Cell Structure I Nucleus Medical Media - 专业讲解，动画一流 Eu 阅读全文

摘要： 完美人类假设：一类人，具有最完美的基因组，享受最健康的环境和饮食，同时拥有最健康的思想情绪，最终以最长的寿命，自然死亡。 自然死亡是自然生命最终的归宿，这是写在目前基因组里的铁律！ 不管科技如何发展，人最终都会追求生命的拓展和延续，所以医学总体是不可能败落的，只是医学的部分低价值的工作会被淘汰。 疾 阅读全文

摘要： 做了好久的RNA-seq分析，基因表达也在口头溜了几年了，但似乎老是浮在表面。 对一件事的了解程度决定了你的思维深度，只想做技工就不用想太多，想做大师就一定要刨根问底。 老是说基因表达，那么什么是基因表达？我们测序得到的基因表达其实只是一种表型，是样本的一个快照，和普通的身高体重之类的连续型表型类似 阅读全文

摘要： 2023年06月21日 Graphpad作图，实验图表还是用这个比较好。 图形必须要素： 对照，一般均值为1 柱状图 + 误差线 显示样本点 显著性检验 中空 + 配色 + 坐标 参考： qPCR-定量PCR-Graphpad 作图教程-数据作图 计算步骤： 一般一种处理即需要一个内参，同一个处理的 阅读全文

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摘要： 2022年10月11日 显著性符号的意义 Symbol Meaning ns P > 0.05 * P ≤ 0.05 ** P ≤ 0.01 *** P ≤ 0.001 **** P ≤ 0.0001 参考：What is the meaning of * or ** or *** in repor 阅读全文

摘要： NIPT, Non-invasive Prenatal Testing - 无创产前基因检测 （学术名词） NIFTY，胎儿染色体异常无创产前基因检测 （注册商标）华大的明显产品 新生儿耳聋基因检测 新生儿遗传代谢病检测 安孕可单基因遗传病携带者筛查 地中海贫血基因检测 安馨可™新生儿及儿童基因检测 阅读全文

摘要： 何川，RNA表观遗传学开创者。早年毕业于中国科技大学，2000年获麻省理工学院博士学位，2000到2002年在哈佛大学做博士后研究，2002年至今执教芝加哥大学化学系, 是芝加哥大学生物物理动态研究所主任, 北京大学合成与功能生物分子中心主任。 目前主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、表观遗传学、 阅读全文

摘要： 生物信息的工具和数据库太多，但有一些基础的工具是必须精通的，甚至需要经常翻阅寻找灵感。 通用数据库： UCSC Genome Browser - 基因组的可视化 OMIM - Online Mendelian Inheritance in Man - 研究疾病必备 专业数据库汇总： 单细胞数据库汇总 阅读全文

摘要： The Lady Tasting Tea - How Statistics Revolutionized Science in the Twentieth Century 本书只讨论了20世纪这100年间的统计大变革。 一般的书读读就行，唯独这本书需要慢慢品读，让统计的思想深入骨髓。 这本书不适合空 阅读全文

摘要： 网页开发，尤其是交互式动态网页的开发，是有一定门槛的，如果你有一定的R基础，又不想过深的接触PHP和MySQL，那R的shiny就是一个不错的选择。 现在R shiny配合R在统计分析上的优势，可以做出非常优秀的科学网站，但我见过的shiny还是多用于本地网站搭建，因为不是每个实验室都能拿出大量的财 阅读全文

摘要： 华大科技服务开发一套优秀的交互式结题报告系统，适用于没有代码基础的老师分析自己的数据。 http://report.bgi.com/ps/login/login.html 体验之后再做评价！ 见云盘：https://pan.genomics.cn/ucdisk/s/RF3Aji 阅读全文

摘要： 需要长期更新！ 参考：生信修炼手册 enhancer的基本概念： 长度几十到几千bp，作用是提高靶基因活性，属于顺式作用原件，DNA作用到DNA，转录因子就是反式，是结合到DNA的蛋白。 1981年，Benerji发现SV40中某个140bp的序列可以显著提高血红蛋白融合基因的表达水平。 特性：远距 阅读全文

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摘要： 这个时代已经是多学科相互渗透的时代，纯粹的传统学科在没落，新兴的交叉学科在不断兴起。 life science neurosciences statistics computer science information theory 我的问题很简单： 想回答这些问题就必须要学习信息论！ 什么是信息？ 阅读全文

摘要： 单细胞技术在飞速发展，随着数据的积累，对应的数据库也相应出现。 CellMarker - 总结了目前的celltype对应的marker，同时给出了数据的文献链接。 Mouse Cell Atlas - 2017年Nature文章，相当于把整个小鼠都测了，得到了一大堆的10x数据，郭国冀。 Pang 阅读全文

摘要： 2022年09月06日 新方法：R | 提取GO分类下的所有基因 library(tidyverse) # library(org.Hs.eg.db) library(org.Mm.eg.db) GOID <- c("GO:0042573") # GOgeneID <- get(GOID, org. 阅读全文