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摘要： 参考：GT sport所有赛道简介 GT Sport - Tip/Guide For FASTER LAP TIMES (Brands Hatch) 赛道介绍、跑法、赛事网上都有大把的视频。 GT sport里的实存赛道，最有名的应该是Nürburgring纽博格林了，这次要分析的是伯蘭士赫治赛道， 阅读全文

摘要： sorry，玩了几天的GT sport才发现赛车有多难，理论的最佳走线是存在的，但是真实的赛道实在是千变万化，弯道形状角度、高低差、F1还有温度和风速，甚至是路面上的一个碎石都会极大地影响你的成绩。赛车的不确定性太大，玩了这么几天发现，只有提高自己的技艺才能减少这种不确定性。极限是存在的，如何控制住 阅读全文

摘要： 2019年03月15日 这两天MBBS监考，为了克服无聊，在监考期间开始了踱步漫想，整理脑中的碎片知识，再次深刻理解了孔夫子的那句话：学而不思则罔，思而不学则殆。 大学硕士博士期间都学过统计，但总感觉统计十分陌生，自认为根本就不理解统计的精髓，一旦到了应用时，心理就犯怯。理解不深主要是学和思都不够。 阅读全文

摘要： 转自：http://www.matrix67.com/blog/archives/105 这或许是众多OIer最大的误区之一。 你会经常看到网上出现“这怎么做，这不是NP问题吗”、“这个只有搜了，这已经被证明是NP问题了”之类的话。你要知道，大多数人此时所说的NP问题其实都是指的NPC问题。他们没有 阅读全文

摘要： paper：A Complete Electron Microscopy Volume of the Brain of Adult Drosophila melanogaster 果蝇是一个非常完美的研究大脑的模式动物，10万级的神经元却已经形成了较为复杂的智能行为，这远比直接研究1000亿级的人类 阅读全文

摘要： Chen, H., Li, C., Peng, X., Zhou, Z., Weinstein, J.N., Liang, H. and Cancer Genome Atlas Research Network, 2018. A Pan-Cancer Analysis of Enhancer Exp 阅读全文

摘要： RNA-seq这个工具该什么时候用？ATAC-seq该什么时候用？有相当一部分项目设计不行，导致花大钱测了一些没有意义的数据。 还是在中心法则这个框架下来解释，这是生物信息的核心。打开华大科技服务官网梳理一下现在到底都有些什么测序技术： 全基因组测序和重测序 - 组装以及寻找变异 （外显子和目标区域 阅读全文

摘要： R批量做GSEA分析还没有官方的包，但是clusterprofiler可以做，它调用了最新的gfsea包。Gene Set Testing for RNA-seq - fgsea教程 RNA-seq是利器，大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据，所以RNA-seq的分析需求应该是很大的（大部分的生 阅读全文

摘要： 有些讲得太烂了，我来通俗的梳理一下R2. Calculating R-squared 在线性回归的模型下，我们可以计算SE(line), SE(y均值)。 The statistic R2describes the proportion of variance in the response var 阅读全文

摘要： 起源：协方差自然是由方差衍生而来的，方差反应的是一个变量（一维）的离散程度，到二维了，我们可以对每个维度求其离散程度，但我们还想知道更多。我们想知道两个维度（变量）之间的关系，直观的举例就是身高和体重（青少年），我们采集到的数据里面有一种固有的性质，那就是身高越高的样本似乎总有着更大的体重，那我们如 阅读全文

摘要： 转自：https://blog.csdn.net/Meditator_hkx/article/details/52823936 序言自从选择了直博这条路，前前后后也看了有二十余篇文献，自己做的毕业设计也算是一个中型的论文，所以对于科研也可以说是稍微有点眉目了吧。 而我相信，每一个研究生（无论博士还是 阅读全文

摘要： 来自英语课的一个练习： https://www.youtube.com/watch?v=ePY3uY1L0X0 next up I'd like to welcome Joshua to ten he's from the ANU College of Medicine biology and th 阅读全文

摘要： 貌似可以随机读取dataframe格式的文本文件。 阅读全文

摘要： 单细胞转录组确实是利器，但我们大多只利用了表达的信息，而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。 最近nature发了一篇单细胞方法类文章，讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。 velocyto velocyto-notebooks RNA velocity of 阅读全文

摘要： Dynamic networks reveal key players in aging 系统生物学中的网络分析 网络的拓扑结构：topological properties， 网络的度：whole network connectivity (degree)，节点度是指和该节点相关联的边的条数，又称 阅读全文

摘要： 在看WGCNA的时候看到的一个术语。 先来看一个随机网络：没有中心节点，大部分节点都均匀的连在一起。 再看一下scale free network：大部分的连接都集中在少数的中心 如何检验一个网络是否是scale free network？ A. Log-log plot of whole-netw 阅读全文

摘要： 2021年09月24日更新 一些必须搞清楚的问题： 为什么GO这么常用且好用？有什么启发？ GO里的注释怎么得到的？可靠吗？有什么局限？ GO的冗余需要处理吗？ 我的回答： 高通量测序后只研究一个基因是没有意义的，而GO BP terms所代表的pathway就是功能的单位，我们可以更全面地了解整个 阅读全文

摘要： 最近在开发一套自己的单细胞分析方法，所以copy paste事业有所停顿。 实例： R eNetIt v0.1-1 一下来自wiki The nearest neighbor graph (NNG) for a set of n objects P in a metric space (e.g., 阅读全文

摘要： 参考： Learning Sparse Neural Networks through L0 Regularization The Variational Garrote 阅读全文

摘要： Consider the data (1, 1, 2, 2, 4, 6, 9). It has a median value of 2. The absolute deviations about 2 are (1, 1, 0, 0, 2, 4, 7) which in turn have a me 阅读全文