小鲨鱼2018

摘要： 001、1-4步骤 002、double click 。 003、 效果 。 阅读全文

摘要： Linux 中 sed命令在通配符作为变量匹配时如何作为传统字符串 01、场景 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt KR24 43.5012 163133 aaak 34.3586 486550 KR.4 26.0377 2063 阅读全文

摘要： 001、 python中格式化字符串f的用法 阅读全文

摘要： 001、原因：二倍体生物，一条染色体的在该位置有碱基，另一条染色体该位置缺失，用*号代替该位置，表示不确定，非特定等位基因 在vcf文件中,正常的表示表示0/0， 0/1， 1/1三种基因型； 如果包含这种不确定的碱基，则会出现2的情况，因此下游分析中通常直接删除掉。 ref: 01、https:/ 阅读全文

摘要： 001、系统信息 (base) [b20223040323@admin2 test]$ cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.6.1810 (Core) 002、官网下载：https://hgdownload.soe.ucsc.edu/admi 阅读全文

摘要： 使用liftover进行不同版本参考基因组坐标的转换 001、软件下载 https://hgdownload.soe.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/ 002、chain文件下载 https://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.ht 阅读全文

摘要： 001、tr [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试文本 aa BB cc dd ee FF jj kk ll mm NN RR [root@PC1 test]# cat a.txt | tr 'a-z' 'A-Z' ## 阅读全文

摘要： megacc构建进化树infer_NJ_distances.mao文件的生成 001、打开mega，点击prototype，选择pairwise distance 002、 003、 004、 保存 。 ref: 01、https://www.omicsclass.com/article/568 阅读全文

摘要： Linux 中 基因组数据基于IBS矩阵构建邻接树 001、 plink计算ibs矩阵 plink --file outcome --distance 1-ibs flat-missing --out ibs 002、 转换为meg格式 echo -e '#Mega\n!ibsmat' | cat 阅读全文

摘要： centos7 中 普通用户megacc命令的安装 001、下载 官网：https://www.megasoftware.net/ 002、 依次点 003、依次点 004、使用以下命令安装 rpm2cpio megax-cc-10.2.6-1.x86_64.rpm | cpio -idmv 005 阅读全文