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001、 。 002、 阅读全文
posted @ 2025-05-02 18:15
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001、bwa + samtools软件比对在4、16、30线程机时费用测试对比 依次修改线程数为4、16、30： bwa mem -t 4 -M -R "@RG\tID:sample_name\tPL:illumina\tSM:sample_name" /PATH/GCF_016772045.2_ 阅读全文
posted @ 2025-05-01 16:00
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分别是用1、2、4、8、16、30线程数目进行测试 001、测试程序 java -jar /public/home/b20223040323/software/trimmomatic/trimmomatic-0.39.jar PE -threads 4 127M_1.fq.gz 127M_2.fq. 阅读全文
posted @ 2025-05-01 10:02
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001、 # 加载必要的包 library(ggplot2) library(scatterpie) library(maps) # 取世界地图 world <- map_data("world") # 模拟三个地点的数据（经纬度 + 三种成分） df <- data.frame( lon = c( 阅读全文
posted @ 2025-04-26 16:23
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Linux 中awk命令如何同时指定两个分割符 001、方法1 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt 01_02 03 04 05 06:07 08 09@10 11 12 13 14 15_6 17 18 19 20 [root@ 阅读全文
posted @ 2025-04-24 17:57
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EIGENSOFT v4.2 软件计算PCA 001、格式转换 step1 plink --file outcome --make-bed --out outcome 002、准备配置文件：outcome.ind (base) [b20223040323@admin2 test3]$ head ou 阅读全文
posted @ 2025-04-23 23:20
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摘要：
centos7 中编译安装 MSMC2软件 001、下载安装包： https://github.com/stschiff/msmc2/archive/refs/tags/v2.1.4.tar.gz 002、解压安装 tar -xzvf v2.1.4.tar.gz cd msmc2-2.1.4/ 00 阅读全文
posted @ 2025-04-23 18:11
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001、非root用户安装、配置gsl环境变量，编译软件环境报错如下： 002、非root用户安装gsl a、下载地址 http://mirrors.ustc.edu.cn/gnu/gsl/gsl-2.5.tar.gz b、编译安装 tar -xzvf gsl-2.5.tar.gz cd gsl-2 阅读全文
posted @ 2025-04-23 17:25
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001、 conda install msmc2 -c bioconda 。 阅读全文
posted @ 2025-04-23 16:27
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摘要：
001、rpm：redhat package manager： -q：query a：all rpm -qa： 列出所有的已经安装的包。 002、等价于 ：yum list installed 阅读全文
posted @ 2025-04-23 15:36
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