随笔分类 - 生信
摘要：001、 a、 conda update -n base -c defaults conda b、当以上命令不管用时，使用如下命令： conda update -n base -c defaults conda --repodata-fn=repodata.json 参考： 01、https://b
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摘要：静态二进制（免安装） 001、系统 (base) [root@pc1 software]# cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.6.1810 (Core) ## centos7.6 002、下载安装包(最新版是2.14.1， 但是centos
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摘要：001、问题 ./rmblastn: /lib64/libz.so.1: version `ZLIB_1.2.9' not found (required by 002、查找库中包含的版本 (base) [root@pc1 bin]# strings /lib64/libz.so.1 | grep
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摘要：001、问题如下： 002、解决方法： 003、 参考： 01、
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摘要：001、问题， ./rmblastn 命令报错如下： ./rmblastn: error while loading shared libraries: libzstd.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory 0
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摘要：一、第一部分， 安装 RepeatMasker 01、安装TRF、github地址：https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF tar -xzvf TRF-4.09.1.tar.gz ./configure make make install 02、安装rm
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摘要：001、make命令报错如下： "none" is not exported by the List::Util module 002、解决方法 将 /usr/local/bin/automake-1.16文件的76行中的 ‘none’删除 (base) [root@pc1 build]# sed
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摘要：001、报错如下：/home/software/TRF/missing: line 81: aclocal-1.16: command not found 002、解决方法 下载automake： 官网:https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/gnu/automake/?
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摘要：最好不要尝试编译安装，报错折腾死人。 001、 (base) [root@pc1 ~]# conda install -c hcc aspera-cli -y 002、调用测试 (base) [root@pc1 ~]# ascp -h | head 。
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摘要：001、cd-hit报错如下 Some seqs are too long, please rebuild the program with make parameter MAX_SEQ=new-maximum-length (e.g. make MAX_SEQ=10000000) 002、解决方法
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摘要：001、问题 cd-hit 编译报错如下： cdhit-common.h:39:17: fatal error: zlib.h: No such file or directory 002、解决方法 yum -y install zlib zlib-devel 003、验证 [root@pc1 cd
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摘要：001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa rm.list test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt
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摘要：001、 单个删除 (base) [root@pc1 test1]# ls a.fa (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试文件 >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt
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摘要：001、 (base) [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py (base) [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 a
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摘要：001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt [root@pc1 test1]#
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摘要：001、 a、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [root@pc1
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摘要：001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa chr.list test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [
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摘要：001、问题：conda安装samtools后调用出现如下报错： samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or d
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摘要：001、问题 conda 安装samtools出现如下问题： (base) [root@pc1 home]# conda install samtools -c bioconda 002、解决方法 更新conda： (base) [root@pc1 home]# conda --version ##
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摘要：001、批量提取，将染色体名称写入到list文件 [root@pc1 test1]# ls a.fa chr.list [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4
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