随笔分类 - 生信
摘要：001、 借助数组实现 a、无序输出 [root@pc1 test]# ls a.fa [root@pc1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aattccgg ttcc >chr2 ttccc >chr3 tttc cct ## 统计脚本 [root@pc1 te
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摘要：001、测试数据 [root@pc1 test]# ls a.txt [root@pc1 test]# cat a.txt ## 测试数据 >jcf7180003470556 2 7 >jcf7180003470556 3 8 >jcf7180003470552 4 9 6 >jcf71800034
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摘要：001、make编译报错：fatal error: lzma.h: No such file or directory 002、 查找相关包 (base) [root@pc1 bedtools2-2.31.1]# yum search "liblzma" Loaded plugins: fastes
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摘要：001、make编译报错：fatal error: bzlib.h: No such file or directory 002、查找相关的安装包 (base) [root@pc1 bedtools2-2.31.1]# yum search bzip2 003、安装相关包 (base) [root@
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摘要：001、问题： version `GLIBCXX_3.4.29' not found （最好不要尝试安装GLIBC库） 002、 当前所处环境为conda 基础环境(base） 003、查找对应的库文件 (base) [b20223040323@admin1 test]$ find ~ -name
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摘要：001、使用命令 及生成结果 samtools flagstat -@ 56 ERR3143219.sort.bam > flagstat.txt ## samtools flagstat统计 002、输出结果解读 (base) [b20223040323@admin1 test]$ cat fla
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摘要：001、编译报错：fatal error: kseq.h: No such file or directory 002、github上查找该软件 003、下载对应的缺失文件，并上传 (base) [root@pc1 test]# ls kseq_fastq_base.c kseq.h 004、编译测
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摘要：001、 (base) [root@pc1 Augustus-3.5.0]# conda install -c bioconda augustus -y ## 直接使用conda安装； 编译安装了一天，没想到conda一个命令安装。。。 002、调用测试 (base) [root@pc1 Augus
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摘要：001、make 编译报错如下：bam2wig.c:12:10: fatal error: bgzf.h: No such file or directory 002、查找该文件 (base) [root@pc1 Augustus-3.5.0]# find / -name "bgzf.h" ## 查
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摘要：001、make编译报错如下：bam2hints.cc:16:10: fatal error: api/BamReader.h: No such file or directory 002、在系统中查找该文件 (base) [root@pc1 Augustus-3.5.0]# find / -nam
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摘要：001、make 编译 报错：train_logReg_param.o:train_logReg_param.cc:(.text+0x3407): more undefined references to `std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...
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摘要：001、make编译报错：/bin/ld: cannot find -lcolamd 002、查找该文件 (py38) [root@pc1 Augustus-3.5.0]# find / -name "libcolamd.so" ## 系统上不存在该文件； 那么解决的话就应该安装， 但是安装什么呢？
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摘要：001、make编译 报错：/bin/ld: cannot find -lmysqlclient 002、查找相关文件 (base) [root@pc1 Augustus-3.5.0]# find / -name *libmysqlclient.so* ## lib + 提示的缺失文件 + .so
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摘要：001、make编译报错：alignment.cc:16:10: fatal error: lp_lib.h: No such file or directory 002、在系统中查找该文件 (base) [root@pc1 Augustus-3.5.0]# find / -name "lp_lib
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摘要：001、make编译遇到如下问题：parser/../../include/contTimeMC.hh:18:10: fatal error: gsl/gsl_matrix.h: No such file or directory 002、查找该文件 (base) [root@pc1 Augustu
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摘要：001、make编译报错：../include/randseqaccess.hh:21:29: fatal error: mysql++/mysql++.h: No such file or directory 002、解决方法： yum -y install epel-release ## 这个在
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摘要：001、make编译报错如下：../include/types.hh:16:43: fatal error: boost/archive/text_oarchive.hpp: No such file or directory 002、 查找该文件 (base) [root@pc1 Augustus
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摘要：001、官网：http://bioinf.uni-greifswald.de/augustus/downloads/ github：https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus/releases/tag/v3.5.0 002、 tar -xzvf August
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摘要：001、编译make 提示错误如下：fsm.h:24:37: fatal error: glib.h: No such file or directory 002、解决方法 (base) [root@pc1 exonerate-2.4.0]# yum install glib* 003、查找该头文件
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摘要：001、安装 (base) [root@pc1 test01]# yum install perl-App-cpanminus.noarch ## 安装； 系统为centos7系统 002、测试安装效果 (base) [root@pc1 test01]# cpanm Usage: cpanm [op
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