摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 公众号有位小朋友留言希望我写一下 的使用。 重新翻了一下之前写的推文，发现我是用意念写完的 ，总感觉我写过这个工具的使用了。 因此这里重新补充一下 工具的使用。 关于 的使用背景我就不多介绍了，之前的文章有写过 "数据合并，踩不完的坑" 下面直接讲一下怎么使用。 这 阅读全文
摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 之前的推文 "GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）" 写过如何用qqman包做曼哈顿图。 但众所周知（据我说知），这个包画图很丑，尤其想highlight显著位点时，屎一样的绿色 阅读全文
摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 1 前言 尽管之前已经有很多的数据库收集了enhancers，比如 、 、`FANTOM5 DENdb dbSUPER SEA`，但这些数据大部分是通过方法、模型推断的，因此其是否有真实的enhancers或promoters活性则需要打个折。 下面简要介绍一个公共 阅读全文
摘要：
使用ggpubr包画显著图时发生以下报错： Warning message: Computation failed in : 二进列运算符中有非数值参数 排查了一下问题，发现软件把我的数值型字符当成character字符型。 因此，这个问题的解决方法就显得很简单了，加上 参数即可。 举个例子，原先的 阅读全文
摘要：
报错原因： 虽然报错内容是含有非数值型数值，但实际情况是我从windows复制数字到linux产生的编码错误。 解决办法： 在linux下重新生成文件。 阅读全文
摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 今天给大家带来“批量计算kaks值”的技能。 关于kaks的背景知识我就不介绍了，感兴趣的自行搜索，这里直接开始讲怎么批量计算kaks值。 1 文件准备 首先准备两个文件，一个是基因的cds序列，一个是蛋白质序列。 cds序列和蛋白质可以在 "ensembl" 网站 阅读全文
摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 有很多的工具可以预测蛋白质结构，比如我之前写过的三篇文章： 1） "蛋白质结构模型和功能预测：Swiss model工具的使用" ：https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/7943409.html 2） "蛋白质结构模型和功能预测： 阅读全文
摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 新年的第一篇更文。 祝大家新春快乐！身体健康！ 18号回家以后，经历了如下过程。 20号 喉咙痛 21号 喉咙痛 22号喉咙痛 咳嗽 23 24号 咳嗽 25号 咳嗽为主 鼻塞 夜间咳嗽加剧 26号 咳嗽为主 鼻塞 流鼻涕 夜间咳嗽加剧 27号 咳嗽为主 鼻塞 流鼻 阅读全文
摘要：
安装R包时产生如下错误： Error in read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 无法打开链结 此外: Warning messages: 1: In download.file(url, destfi 阅读全文
摘要：
欢迎来到"bio生物信息"的世界 今天，为大家带来一个在线网站 "datamonkey" ，可以同时检测支系、基因、位点的选择压力。 datamonkey网址：http://www.datamonkey.org/ 网站长这样： 该网站接受三种输入模式，分别为NEXUS、PHYLIP、FASTA。 另 阅读全文