橙子牛奶糖

摘要： 比如原格式文件linear.xlsx是这样的： VA1和VA2是两个变量，想把它变成以下格式： 则用reshape2包转换： library(openxlsx) library(reshape2) sw<-read.xlsx("E:/linear.xlsx", sheet = 1, colNames 阅读全文

摘要： 最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画，haploview软件毛病比较多，比如不能有多态位点，输入的变异位点不能太多等。动不动就报错。 最近试了一下另外一个画LD block的软件LDBlockShow，比haploview好用许多。不需要自己剔除多态位点，直接输入vcf文件 阅读全文

摘要： 1、首先，用find / -name "libstdc++.so*"命令查找包含“libstdc++.so”的所有文件； 2、假定找到的其中一个在/chenwenyan/lib/libstdc++.so.6路径下，用命令strings /chenwenyan/lib/libstdc++.so.6 | 阅读全文

摘要： 最近，看到Front. Genet.发了一篇文章“IntAssoPlot: An R Package for Integrated Visualization of Genome-Wide Association Study Results With Gene Structure and Linka 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递 一 文献题目： Korean Genome Project: 1094 Korean personal genomes with clinical information 不想看英文题目： 韩国基因组计划：拥有临床信息的1094个韩国个人基因组 杂志和影响因子： Sci Adv ( 阅读全文

摘要： 介绍一个网站Genealogical Estimation of Variant Age (GEVA)。网址：https://human.genome.dating 看名字就知道这个网站是评估SNP位点突变年龄。 该网站是今年发表在PLoS biology的一篇文献“Dating genomic v 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递 一 文献题目： Testing and controlling for horizontal pleiotropy with probabilistic Mendelian randomization in transcriptome-wide association studie 阅读全文

摘要： 很多人问过我敏感性分析的问题，说明大家对敏感性分析普遍是有疑问的，我之前的推文中也没有详细的讲过，因此决定写这一篇补充一下敏感性分析的工作。 什么是敏感性分析 敏感性分析定义：敏感度分析是研究数学模型或系统(数值或其他)输出中的不确定性如何在其输入中被分配到不同的不确定性来源 ——摘自维基百科。 我 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递 一 文献题目： Multi-faceted epigenetic dysregulation of gene expression promotes esophageal squamous cell carcinoma 不想看英文题目： 基因表达的多方面表观遗传失调促进食管鳞状细胞 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递 一 （将不完全相似的表型进行荟萃分析，找出新的遗传位点，这是我第二次见到文献进行这种操作，一个新思路，值得借鉴） 文献题目： Multivariate genomic scan implicates novel loci and haem metabolism in human a 阅读全文