摘要: ## 1、 基因ID转换工具 https://hum-molgen.org/NewsGen/08-2009/000020.html ## 2、 the known binding sites of all TFs R 包 MotifDb: https://github.com/PriceLab/Mo 阅读全文
posted @ 2021-06-14 13:51 橙子牛奶糖 阅读(2440) 评论(2) 推荐(1)
摘要: 这些年,陆陆续续收到不少小伙伴问我怎么在文章中致谢我,给个统一模板: We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分请自由发挥。 阅读全文
posted @ 2021-06-03 21:54 橙子牛奶糖 阅读(937) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文
posted @ 2021-06-02 22:53 橙子牛奶糖 阅读(1549) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 时隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程,后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的**「你们」**~ by 「橙子牛奶糖(陈文燕)」 1.前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程 阅读全文
posted @ 2019-11-06 09:49 橙子牛奶糖 阅读(25340) 评论(13) 推荐(12)
摘要: 1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型(genotype)、是否能下载到GWAS结果文件(P值、效应值、SNP位点)。目前收集到的有如下: 参考到这些数据库的文献:Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 阅读全文
posted @ 2018-04-28 20:03 橙子牛奶糖 阅读(24457) 评论(1) 推荐(2)
摘要: 1. 文章标题: Aberrant cellular communities underlying disease heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease 中文标题: 揭示慢阻肺异质性根源!构建异常细胞群落空间图谱,精准解析疾病病 阅读全文
posted @ 2026-01-23 23:35 橙子牛奶糖 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Article Title: A breakage–replication-fusion process explains complex rearrangements and segmental DNA amplification 中文标题: 染色体碎裂机制重塑!“断裂-复制-融合”过程揭示复杂基 阅读全文
posted @ 2026-01-15 20:35 橙子牛奶糖 阅读(8) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Article Title: Protein–protein interactions shape trans-regulatory impact of genetic variation on protein expression and complex traits 中文标题: 揭示基因调控新机 阅读全文
posted @ 2026-01-15 19:03 橙子牛奶糖 阅读(4) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章 1 文章标题:An expanded registry of candidate cis-regulatory elements 中文标题:ENCODE新篇章!237万个人类顺式调控元件图谱揭示基因调控奥秘 关键词:顺式调控元件、ENCODE计划、基因表达调控、功能基因组学、全基因组关联分析 阅读全文
posted @ 2026-01-12 22:10 橙子牛奶糖 阅读(19) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题: Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis 中文标题: 肝脏适应慢性代谢应激是肿瘤发生的“预演” 关键词: 肝细胞癌、慢性代谢应激、单细胞多组学、空间转录组、肿瘤发生 摘要总结: 这篇文章通过整合 阅读全文
posted @ 2026-01-08 23:15 橙子牛奶糖 阅读(35) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题: The genetics, evolution, and maintenance of a biological rock-paper-scissors game 中文标题: 揭秘侧斑蜥蜴的遗传博弈!双等位基因与表型可塑性如何维持生物多样性? 关键词: 侧斑蜥蜴、多态性、表型可塑性、平衡 阅读全文
posted @ 2026-01-04 21:58 橙子牛奶糖 阅读(33) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:Multitrait analyses identify genetic variants associated with aortic valve function and aortic stenosis risk 中文标题:深度学习结合多性状分析,揭示主动脉瓣狭窄的遗传风险与干预靶点! 阅读全文
posted @ 2025-12-25 23:11 橙子牛奶糖 阅读(18) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. 文章标题:Genomic evidence for the Holocene codispersal of dogs and humans across Eastern Eurasia 中文标题: 揭示人犬共舞万年史!古基因组实证全新世东欧亚大陆的人犬协同迁徙 关键词: 古DNA、犬类驯化、协 阅读全文
posted @ 2025-12-18 23:12 橙子牛奶糖 阅读(34) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness 中文标题: 揭秘细胞如何感知硬度!发现“机械增强子”调控基因表达与细胞行为的新机制 关键词: 机械转导、基因组增强 阅读全文
posted @ 2025-12-18 23:06 橙子牛奶糖 阅读(13) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:Whole-genome landscapes of 1,364 breast cancers 中文标题: 绘制最大规模乳腺癌全基因组图谱!揭示驱动基因与临床预后的深层关联 关键词: 乳腺癌、全基因组测序、驱动基因、同源重组缺陷、临床预后 摘要总结: 这篇文章通过对1,364例具有详细临床 阅读全文
posted @ 2025-12-16 22:50 橙子牛奶糖 阅读(20) 评论(0) 推荐(0)