摘要: ## 1、 基因ID转换工具 https://hum-molgen.org/NewsGen/08-2009/000020.html ## 2、 the known binding sites of all TFs R 包 MotifDb: https://github.com/PriceLab/Mo 阅读全文
posted @ 2021-06-14 13:51 橙子牛奶糖 阅读(2497) 评论(2) 推荐(1)
摘要: 这些年,陆陆续续收到不少小伙伴问我怎么在文章中致谢我,给个统一模板: We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分请自由发挥。 阅读全文
posted @ 2021-06-03 21:54 橙子牛奶糖 阅读(978) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文
posted @ 2021-06-02 22:53 橙子牛奶糖 阅读(1593) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 时隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程,后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的**「你们」**~ by 「橙子牛奶糖(陈文燕)」 1.前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程 阅读全文
posted @ 2019-11-06 09:49 橙子牛奶糖 阅读(25615) 评论(13) 推荐(12)
摘要: 1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型(genotype)、是否能下载到GWAS结果文件(P值、效应值、SNP位点)。目前收集到的有如下: 参考到这些数据库的文献:Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 阅读全文
posted @ 2018-04-28 20:03 橙子牛奶糖 阅读(24644) 评论(1) 推荐(2)
摘要: 1. In vivo genome-wide CRISPR screens of human T cells in solid tumours 中文标题 破解实体瘤免疫困境:全基因组筛选找到增强T细胞杀伤力的新靶点 关键词 CRISPR筛选、T细胞免疫治疗、实体瘤、CAR-T细胞、GPCR信号 摘要 阅读全文
posted @ 2026-09-23 16:25 橙子牛奶糖 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Virus reactivation in acute and long COVID-19 中文标题 新冠感染为何拖成长期症状?病毒再激活揭示慢性炎症背后的隐藏机制 关键词 新冠病毒、病毒再激活、多组学分析、免疫炎症、长期新冠 摘要总结 新冠病毒感染带来的影响,并不一定随着病毒清除而完全结束。 阅读全文
posted @ 2026-09-18 19:32 橙子牛奶糖 阅读(18) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. A dependency map enhanced with next-generation 3D cancer models 中文标题 告别二维细胞局限!三维类器官升级癌症依赖图谱,发现精准治疗新靶点 关键词 癌症依赖图谱、三维类器官、CRISPR筛选、多组学分析、精准肿瘤治疗 摘要总结 过 阅读全文
posted @ 2026-09-18 11:32 橙子牛奶糖 阅读(11) 评论(0) 推荐(1)
摘要: 1. Somatic mutations reveal the ontogeny of microglia in human aging 中文标题 体细胞突变追踪揭示衰老人脑中小胶质细胞的来源与动态补充机制 关键词 小胶质细胞、体细胞突变、谱系追踪、克隆造血、人类衰老 摘要总结 小胶质细胞(micr 阅读全文
posted @ 2026-09-03 18:27 橙子牛奶糖 阅读(31) 评论(0) 推荐(1)
摘要: 1. Subnuclear genome compartmentalization controls bivalent chromatin activity 中文标题 从核膜到核斑:基因空间迁移如何开启神经发育程序 关键词 空间基因组、双价染色质、核纤层、核斑、皮层神经发生 摘要总结 发育相关基因经 阅读全文
posted @ 2026-09-01 17:03 橙子牛奶糖 阅读(33) 评论(0) 推荐(1)
摘要: 1. Genetic background sets the trajectory of experimental cancer evolution 中文标题 同一个致癌突变,为何换个遗传背景就走向另一种癌症结局? 关键词 癌症进化、遗传背景、驱动突变、种系—体细胞互作、克隆选择 研究内容 癌症研究 阅读全文
posted @ 2026-08-14 18:37 橙子牛奶糖 阅读(22) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Genome-wide association analyses of gestational phenotypes identify context-specific genetic effects 中文标题 怀孕会重写基因效应吗?绘制40周动态遗传图谱 关键词 妊娠表型、无创产前检测、全基 阅读全文
posted @ 2026-08-07 17:35 橙子牛奶糖 阅读(21) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Extending genome-wide association studies to admixed cohorts with high degrees of relatedness 中文标题: 让混合祖源家系不再被GWAS拒之门外 **关键词: 混合祖源、局部祖源、样本亲缘关系、广义线性 阅读全文
posted @ 2026-08-05 16:57 橙子牛奶糖 阅读(16) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Pangenome-resolved structural variation drives adaptation and trait evolution in cucumber 文章标题 Pangenome-resolved structural variation drives adapt 阅读全文
posted @ 2026-07-31 18:53 橙子牛奶糖 阅读(35) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Universal cell embedding provides a foundation model for cell biology 文章标题: Universal cell embedding provides a foundation model for cell biology 中 阅读全文
posted @ 2026-07-22 17:18 橙子牛奶糖 阅读(39) 评论(0) 推荐(0)