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## 1、 基因ID转换工具 https://hum-molgen.org/NewsGen/08-2009/000020.html ## 2、 the known binding sites of all TFs R 包 MotifDb： https://github.com/PriceLab/Mo 阅读全文
posted @ 2021-06-14 13:51
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这些年，陆陆续续收到不少小伙伴问我怎么在文章中致谢我，给个统一模板： We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分请自由发挥。 阅读全文
posted @ 2021-06-03 21:54
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1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文
posted @ 2021-06-02 22:53
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时隔一年多，于今日（20210313）再次更新教程，后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的**「你们」**~ by 「橙子牛奶糖（陈文燕）」 1.前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析（GWAS）原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得，做这个分析，先从跑流程 阅读全文
posted @ 2019-11-06 09:49
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1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型（genotype）、是否能下载到GWAS结果文件（P值、效应值、SNP位点）。目前收集到的有如下： 参考到这些数据库的文献：Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 阅读全文
posted @ 2018-04-28 20:03
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文章标题：CytoSignal detects locations and dynamics of ligand–receptor signaling at cellular resolution from spatial transcriptomic data 中文标题：空间解析细胞通信与信号动态 阅读全文
posted @ 2026-06-29 18:35
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原文标题 Decoding common and rare noncoding variant effects across cellular and developmental contexts 中文标题 跨细胞发育解析非编码变异调控密码 关键词 非编码变异、深度学习、染色质可及性、细胞类型特异性 阅读全文
posted @ 2026-06-25 15:13
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1. High-resolution single-cell mapping of clonal hematopoiesis and structural variation in aplastic anemia 中文标题 单细胞追踪再障克隆进化：免疫逃逸如何塑造造血命运 关键词 再生障碍性贫血、克 阅读全文
posted @ 2026-06-15 17:23
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Integrative analyses elucidate transcriptional regulatory functions of risk alleles for metabolic liver disease 中文标题：揭示代谢性肝病风险等位基因的转录调控作用 关键词：MASLD、非编 阅读全文
posted @ 2026-06-12 18:33
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1. 文章标题： Aberrant cellular communities underlying disease heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease 中文标题： 揭示慢阻肺异质性根源！构建异常细胞群落空间图谱，精准解析疾病病 阅读全文
posted @ 2026-01-23 23:35
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Article Title: A breakage–replication-fusion process explains complex rearrangements and segmental DNA amplification 中文标题： 染色体碎裂机制重塑！“断裂-复制-融合”过程揭示复杂基 阅读全文
posted @ 2026-01-15 20:35
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Article Title: Protein–protein interactions shape trans-regulatory impact of genetic variation on protein expression and complex traits 中文标题： 揭示基因调控新机 阅读全文
posted @ 2026-01-15 19:03
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文章 1 文章标题：An expanded registry of candidate cis-regulatory elements 中文标题：ENCODE新篇章！237万个人类顺式调控元件图谱揭示基因调控奥秘 关键词：顺式调控元件、ENCODE计划、基因表达调控、功能基因组学、全基因组关联分析 阅读全文
posted @ 2026-01-12 22:10
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文章标题： Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis 中文标题： 肝脏适应慢性代谢应激是肿瘤发生的“预演” 关键词： 肝细胞癌、慢性代谢应激、单细胞多组学、空间转录组、肿瘤发生 摘要总结： 这篇文章通过整合 阅读全文
posted @ 2026-01-08 23:15
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文章标题： The genetics, evolution, and maintenance of a biological rock-paper-scissors game 中文标题： 揭秘侧斑蜥蜴的遗传博弈！双等位基因与表型可塑性如何维持生物多样性？ 关键词： 侧斑蜥蜴、多态性、表型可塑性、平衡 阅读全文
posted @ 2026-01-04 21:58
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