摘要: ## 1、 基因ID转换工具 https://hum-molgen.org/NewsGen/08-2009/000020.html ## 2、 the known binding sites of all TFs R 包 MotifDb: https://github.com/PriceLab/Mo 阅读全文
posted @ 2021-06-14 13:51 橙子牛奶糖 阅读(2489) 评论(2) 推荐(1)
摘要: 这些年,陆陆续续收到不少小伙伴问我怎么在文章中致谢我,给个统一模板: We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分请自由发挥。 阅读全文
posted @ 2021-06-03 21:54 橙子牛奶糖 阅读(971) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文
posted @ 2021-06-02 22:53 橙子牛奶糖 阅读(1582) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 时隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程,后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的**「你们」**~ by 「橙子牛奶糖(陈文燕)」 1.前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程 阅读全文
posted @ 2019-11-06 09:49 橙子牛奶糖 阅读(25582) 评论(13) 推荐(12)
摘要: 1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型(genotype)、是否能下载到GWAS结果文件(P值、效应值、SNP位点)。目前收集到的有如下: 参考到这些数据库的文献:Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 阅读全文
posted @ 2018-04-28 20:03 橙子牛奶糖 阅读(24603) 评论(1) 推荐(2)
摘要: 1. Genetic background sets the trajectory of experimental cancer evolution 中文标题 同一个致癌突变,为何换个遗传背景就走向另一种癌症结局? 关键词 癌症进化、遗传背景、驱动突变、种系—体细胞互作、克隆选择 研究内容 癌症研究 阅读全文
posted @ 2026-08-14 18:37 橙子牛奶糖 阅读(8) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Genome-wide association analyses of gestational phenotypes identify context-specific genetic effects 中文标题 怀孕会重写基因效应吗?绘制40周动态遗传图谱 关键词 妊娠表型、无创产前检测、全基 阅读全文
posted @ 2026-08-07 17:35 橙子牛奶糖 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Extending genome-wide association studies to admixed cohorts with high degrees of relatedness 中文标题: 让混合祖源家系不再被GWAS拒之门外 **关键词: 混合祖源、局部祖源、样本亲缘关系、广义线性 阅读全文
posted @ 2026-08-05 16:57 橙子牛奶糖 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Pangenome-resolved structural variation drives adaptation and trait evolution in cucumber 文章标题 Pangenome-resolved structural variation drives adapt 阅读全文
posted @ 2026-07-31 18:53 橙子牛奶糖 阅读(18) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Universal cell embedding provides a foundation model for cell biology 文章标题: Universal cell embedding provides a foundation model for cell biology 中 阅读全文
posted @ 2026-07-22 17:18 橙子牛奶糖 阅读(13) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. 视觉皮层神经元的转录组—投射组整合研究 文章标题: Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in the mouse visual cortex 中文标题: 破译神经元远程线路:从单细胞转录组连接全脑投射图 关键词: 单细胞转录 阅读全文
posted @ 2026-07-21 16:17 橙子牛奶糖 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、Multiomics analysis of primary metabolism reveals the genetic basis of nitrogen partitioning modulated by ZmAVT1A-1 in maize 文章标题 Multiomics analysi 阅读全文
posted @ 2026-07-20 11:27 橙子牛奶糖 阅读(21) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Enhancer control of promoter activity and variability via frequency modulation of clustered transcriptional bursts 文章标题: Enhancer control of promot 阅读全文
posted @ 2026-07-17 17:20 橙子牛奶糖 阅读(26) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 第一篇 文章标题 No evidence of immunosurveillance in mutation-hotspot-driven clonal hematopoiesis 中文标题 免疫系统真的在清场吗?克隆性造血未见免疫监视 关键词 克隆性造血、免疫监视、MHC结合、体细胞突变、UK B 阅读全文
posted @ 2026-07-17 16:27 橙子牛奶糖 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:CytoSignal detects locations and dynamics of ligand–receptor signaling at cellular resolution from spatial transcriptomic data 中文标题:空间解析细胞通信与信号动态 阅读全文
posted @ 2026-06-29 18:35 橙子牛奶糖 阅读(25) 评论(0) 推荐(0)