摘要：
使用p1 <- prcomp_irlba(beta, n=20)进行PCA计算，一直报错： Error in (function (A, nv = 5, nu = nv, maxit = 1000, work = nv + 7, reorth = TRUE, : BLAS/LAPACK 例行程序'D 阅读全文
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这篇应该是甲基化QC的最后一篇啦。 感谢健明带入门。 我前面已经写完两篇： QC1:甲基化数据QC：使用甲基化数据计算样本间的相关性 QC2:甲基化数据QC: 使用甲基化数据推测SNP基因型（ewastools工具） 下面补充一下对甲基化样本和CpG位点QC的总流程： 1、导入、加载安装包 if ( 阅读全文
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本周最新文献速递，如约而至~ 一 **文献题目：**Genome-wide Association Study for Alcohol-related Cirrhosis Identifies Risk Loci in MARC1 and HNRNPUL1 **不想看英文题目：**全基因组关联研究确 阅读全文
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PrediXcan , SPrediXcan，MetaXcan是近些年基于GWAS后续分析开发出来的工具。 主要功能是在组织和表达的层面预测影响表型的基因，弥补了GWAS只能在基因组层面解释表型的不足。 下面是这几个工具的工作流程： 今天给大家介绍一下如何使用SPrediXcan和MetaXcan工 阅读全文
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本周最新文献速递 ###一 **文献题目：**Clonal Myelopoiesis in the UK Biobank Cohort: ASXL1 Mutations Are Strongly Associated With Smoking **不想看英文题目：**UK Biobank克隆性造血研 阅读全文
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本周最新文献速递 ###一 **文献题目：**Identification of Type 2 Diabetes Loci in 433,540 East Asian Individuals **不想看英文题目：**43万东亚人的二型糖尿病遗传位点鉴定 **杂志和影响因子：**Nature (IF: 阅读全文
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介绍一下如何使用ewastools推测甲基化数据的SNP基因型 ###下载、安装ewastools 以下例子是ewastools的安装，其他的包比如magrittr、svd等, 电脑没装的话，也需要一一装上去。 如果install.packages()装不了，就用BiocManager::insta 阅读全文
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本周最新文献速递 ###一 **文献题目：**Identification of ALK in Thinness **不想看英文题目：**ALK基因：让人更瘦 **杂志和影响因子：**Cell (IF: 36.216) **样本量：**以BMI低于6%的881个个体作为case，BMI在30-50% 阅读全文
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前几天，Nucleic Acids Res新发了一篇文章，关于查找基因组调控元件的网页在线工具EpiRegio：https://epiregio.de/。 具体来说，该工具有以下三个功能： 1）通过给定一系列的感兴趣基因，查找调控基因的元件； 2）通过给定一系列基因组区域，查找该区域是否有调控元件； 阅读全文
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说起来我粉许嵩很多年了。 但我并不算严格意义上的忠粉，我没有去过他的演唱会、没买过他的专辑、平常听他的歌也比较少。 只是偶尔，遇到不开心的事，就会听听许嵩的歌，看看许嵩的文字。 许嵩的歌风格多样。 失恋了听听全球变冷、梧桐灯、早睡身体好、灰色头像； 被误解了听听别咬我、遛你玩、我无所谓、安徒生不后悔 阅读全文