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摘要: ## 1、 基因ID转换工具 https://hum-molgen.org/NewsGen/08-2009/000020.html ## 2、 the known binding sites of all TFs R 包 MotifDb: https://github.com/PriceLab/Mo 阅读全文
posted @ 2021-06-14 13:51 橙子牛奶糖 阅读(2436) 评论(2) 推荐(1)
摘要: 这些年,陆陆续续收到不少小伙伴问我怎么在文章中致谢我,给个统一模板: We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分请自由发挥。 阅读全文
posted @ 2021-06-03 21:54 橙子牛奶糖 阅读(935) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文
posted @ 2021-06-02 22:53 橙子牛奶糖 阅读(1546) 评论(0) 推荐(2)
摘要: 时隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程,后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的**「你们」**~ by 「橙子牛奶糖(陈文燕)」 1.前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程 阅读全文
posted @ 2019-11-06 09:49 橙子牛奶糖 阅读(25295) 评论(13) 推荐(12)
摘要: 1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型(genotype)、是否能下载到GWAS结果文件(P值、效应值、SNP位点)。目前收集到的有如下: 参考到这些数据库的文献:Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 阅读全文
posted @ 2018-04-28 20:03 橙子牛奶糖 阅读(24446) 评论(1) 推荐(2)
摘要: 文章标题: Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis 中文标题: 肝脏适应慢性代谢应激是肿瘤发生的“预演” 关键词: 肝细胞癌、慢性代谢应激、单细胞多组学、空间转录组、肿瘤发生 摘要总结: 这篇文章通过整合 阅读全文
posted @ 2026-01-08 23:15 橙子牛奶糖 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题: The genetics, evolution, and maintenance of a biological rock-paper-scissors game 中文标题: 揭秘侧斑蜥蜴的遗传博弈!双等位基因与表型可塑性如何维持生物多样性? 关键词: 侧斑蜥蜴、多态性、表型可塑性、平衡 阅读全文
posted @ 2026-01-04 21:58 橙子牛奶糖 阅读(21) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:Multitrait analyses identify genetic variants associated with aortic valve function and aortic stenosis risk 中文标题:深度学习结合多性状分析,揭示主动脉瓣狭窄的遗传风险与干预靶点! 阅读全文
posted @ 2025-12-25 23:11 橙子牛奶糖 阅读(15) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. 文章标题:Genomic evidence for the Holocene codispersal of dogs and humans across Eastern Eurasia 中文标题: 揭示人犬共舞万年史!古基因组实证全新世东欧亚大陆的人犬协同迁徙 关键词: 古DNA、犬类驯化、协 阅读全文
posted @ 2025-12-18 23:12 橙子牛奶糖 阅读(20) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness 中文标题: 揭秘细胞如何感知硬度!发现“机械增强子”调控基因表达与细胞行为的新机制 关键词: 机械转导、基因组增强 阅读全文
posted @ 2025-12-18 23:06 橙子牛奶糖 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题:Whole-genome landscapes of 1,364 breast cancers 中文标题: 绘制最大规模乳腺癌全基因组图谱!揭示驱动基因与临床预后的深层关联 关键词: 乳腺癌、全基因组测序、驱动基因、同源重组缺陷、临床预后 摘要总结: 这篇文章通过对1,364例具有详细临床 阅读全文
posted @ 2025-12-16 22:50 橙子牛奶糖 阅读(17) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1. Somatic evolution following cancer treatment in normal tissue 中文标题: 揭秘化疗的“双刃剑”效应!深度测序揭示癌症治疗如何重塑正常组织的体细胞进化 关键词: 体细胞进化、癌症治疗、突变特征、克隆选择、正常组织 摘要总结: 这篇文章 阅读全文
posted @ 2025-12-16 22:36 橙子牛奶糖 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题: Multimodal AI generates virtual population for tumor microenvironment modeling 中文标题: AI重磅突破!H&E图像秒变多重免疫荧光,肿瘤微环境建模迈入新纪元! 关键词: 多模态AI、肿瘤微环境、虚拟多重免疫荧 阅读全文
posted @ 2025-12-10 22:41 橙子牛奶糖 阅读(38) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题: Long-read metagenomics reveals phage dynamics in the human gut microbiome 中文标题: 宏基因组长读测序揭示人类肠道噬菌体“生存法则” 关键词: 肠道微生物组、噬菌体、长读测序、噬菌体-宿主相互作用、水平基因转移、I 阅读全文
posted @ 2025-11-30 21:02 橙子牛奶糖 阅读(24) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文章标题: MAPK-driven epithelial cell plasticity drives colorectal cancer therapeutic resistance 中文标题: 结直肠癌耐药新机制:MAPK信号驱动上皮细胞可塑性上演“绝地反击” 关键词: 结直肠癌、MAPK信号通 阅读全文
posted @ 2025-11-30 20:56 橙子牛奶糖 阅读(23) 评论(0) 推荐(0)
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