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橙子牛奶糖

简介:陈文燕,本科暨南大学,中科院博士。 欢迎关注微信公众号“bio生物信息”,进群与众多生信同行一起讨论学术问题。私信不回,有问题请在文章下面评论。

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公共数据库信息汇总(20210926更新)

1. 人类基因组转录起始位点 TSS

http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz
http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/3.1/00README.txt

human refGene hg19 TSS:
https://raw.githubusercontent.com/Shicheng-Guo/AnnotationDatabase/master/hg19/refGene_hg19_TSS.bed

human refGene hg38 TSS:
https://raw.githubusercontent.com/Shicheng-Guo/AnnotationDatabase/master/hg38/refGene.hg38.TSS.bed

2. 各种match的数据类型

网址:https://www.encodeproject.org/




3. oncogenes/tumor suppressor genes 致癌基因/抑癌基因数据库


图片来源:http://www.bushmanlab.org/links/genelists

https://cancer.sanger.ac.uk/census
https://www.cancerquest.org/cancer-biology/cancer-genes#1
https://bioinfo.uth.edu/TSGene1.0/

4. iGenomes 不同物种的注释

https://support.illumina.com/sequencing/sequencing_software/igenome.html

5. SNP与转录因子

http://ccg.vital-it.ch/snp2tfbs/

本文来自博客园,作者:橙子牛奶糖(陈文燕),转载请注明原文链接:https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/14843265.html

posted @ 2021-06-02 22:53  橙子牛奶糖  阅读(1531)  评论(0)    收藏  举报
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