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【动植物研究动态】20220722文献解读
摘要：Science | 农科院作科所周文彬：水稻中转录因子OsDREB1C同时提高光合作用效率和氮素利用效率 A transcriptional regulator that boosts grain yields and shortens the growth duration of rice 该研究 阅读全文
posted @ 2022-07-23 00:10 生物信息与育种 阅读(636) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220626文献解读
摘要：最近很久没有更新，实在是生活中事情太多，节奏完全被打乱了。 PBJ | 中国农业科学院棉花研究所揭示表达新等位基因动态调控棉花纤维长度的分子机理 Expressed- genes and their new alleles identification during fibre elongation 阅读全文
posted @ 2022-06-26 23:11 生物信息与育种 阅读(440) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220605文献解读
摘要：PBJ | 中科院遗传发育所田志喜：克隆调控大豆籽粒大小和品质的重要基因 Natural allelic variation of GmST05 controlling seed size and quality in soybean 该研究通过对1800多份大豆种质资源籽粒厚度性状的全基因组关联分 阅读全文
posted @ 2022-06-05 22:18 生物信息与育种 阅读(420) 评论(0) 推荐(0)
TWAS: 变异-基因表达-表型三者之间的关系？
摘要：变异、基因表达和表型三者之间的关系很复杂，近期研究相关，头都想破了。然而很早以前就有人研究并总结过了。这里贴一个2015年发表NG上的TWAS综述，备忘。 TWAS研究路线： SNP、基因表达和表型三者之间的关系类型划分： Gusev A et al., Integrative approaches 阅读全文
posted @ 2022-05-29 23:35 生物信息与育种 阅读(362) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220529文献解读
摘要：Cell | 黄学辉/黄三文/韩斌/李家洋受邀发表作物驯化育种的遗传学研究综述 The integrated genomics of crop domestication and breeding 该论文系统梳理了近十年作物遗传学领域的重要研究进展，包括对作物遗传信息的读取（作物参考基因组和群体基因 阅读全文
posted @ 2022-05-29 23:16 生物信息与育种 阅读(317) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220522文献解读
摘要：Nature | 瑞典隆德食品科学组织：燕麦基因组为健康谷物提供新见解 The mosaic oat genome gives insights into a uniquely healthy cereal crop 栽培燕麦 (Avena sativa L.) 是一种异源六倍体 (AACCDD, 阅读全文
posted @ 2022-05-22 23:04 生物信息与育种 阅读(563) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220515文献解读
摘要：Nature Genetics | 福建农林大学等：揭示植物基因枪介导的转基因过程及番木瓜的驯化历史 SunUp and Sunset genomes revealed impact of particle bombardment mediated transformation and domest 阅读全文
posted @ 2022-05-16 11:48 生物信息与育种 阅读(201) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220508文献解读
摘要：Plant Com | 浙大张国平&湖南农大吴德志：解析盐生植物海大麦基因组及其耐盐机制 The genome and gene editing system of sea barleygrass provide a novel platform for cereal domestication a 阅读全文
posted @ 2022-05-08 00:00 生物信息与育种 阅读(193) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220501文献解读
摘要：NG | 农科院油料所伍晓明&诺禾：揭示现代油菜遗传改良的基因组学基础 Genomic selection and genetic architecture of agronomic traits during modern rapeseed breeding 基于418份现代油菜种质高深度重测序数 阅读全文
posted @ 2022-04-30 23:57 生物信息与育种 阅读(361) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220424文献解读
摘要：The Crop Journal | 农科院深圳基因组所钱前&商连光&胡冠菁：利用GWAS和转录组解析水稻高温胁迫响应基因及其表达模式 Identifying candidate genes and patterns of heat-stress response in rice using a g 阅读全文
posted @ 2022-04-24 23:57 生物信息与育种 阅读(461) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220417文献解读
摘要：Genome Research | 上海交大&农科院作科所徐建龙：基于三代测序数据的水稻泛基因组构建及分析 Long-read sequencing of 111 rice genomes reveals significantly larger pan-genomes 该研究通过引入一系列新方法处 阅读全文
posted @ 2022-04-17 23:19 生物信息与育种 阅读(198) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220410文献解读
摘要：Hortic Res | 意大利巴里大学：基于不同种植地豌豆的基因型数据揭示豌豆遗传进化史 Merging genotyping-by-sequencing data from two ex situ collections provides insights on the pea evolutio 阅读全文
posted @ 2022-04-09 23:35 生物信息与育种 阅读(216) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220403文献解读
摘要：PBJ | 西北农林：苹果优良砧木富平楸子高质量基因组，揭示楸子遗传起源及嫁接介导的抗性机理 A Chromosome-Scale Reference Genome Provides Insights into the Genetic Origin and Grafting-Mediated Str 阅读全文
posted @ 2022-04-04 12:12 生物信息与育种 阅读(254) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220327文献解读
摘要：Science |中农华农：杨小红&严建兵&李建生：系统解析了玉米和水稻趋同选择的遗传基础 Convergent selection of a WD40 protein that enhances grain yield in maize and rice 应该是今年的爆款文章了。 揭示了穗粒数基因 阅读全文
posted @ 2022-03-27 22:35 生物信息与育种 阅读(216) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220320文献解读
摘要：Nature Genetics | 抗条锈病小麦品种Kariega基因组组装与抗病基因Yr27挖掘 Long-read genome sequencing of bread wheat facilitates disease resistance gene cloning 沙特阿拉伯阿卜杜拉科技大学 阅读全文
posted @ 2022-03-20 22:15 生物信息与育种 阅读(376) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】20220313文献摘选
摘要：Hortic Res | 中国医科院药植所卢善发：药用植物北马兜铃染色体水平的基因组图谱 Chromosome-level genome assembly of Aristolochia contorta provides insights into the biosynthesis of benz 阅读全文
posted @ 2022-03-13 22:41 生物信息与育种 阅读(287) 评论(0) 推荐(0)
等位基因特异性表达(ASE)及顺反式调控研究的相关分析整理
摘要：在对动植物杂交种（或F1子代）的基因组和转录组的关联研究中，要回答这么一个问题：基因组变异到底与基因表达有什么关系？ 这个问题很难，因为涉及影响基因表达调控的因素可太多了！多少科研人员围绕着这个问题研究毕生。 但不可避免的要做等位基因特异性表达（allele-specific expression, 阅读全文
posted @ 2022-03-11 22:24 生物信息与育种 阅读(5479) 评论(2) 推荐(2)
【动植物研究动态】2022年1-3月MP发表的油菜变异数据库、大白菜突变体数据库、GWAS新方法和GS4.0
摘要：MP作为国内植物领域神刊，发展非常之快。开年之际，国人就已发表好几项卓越成果。这里摘取几项跟分子育种相关的研究，涉及工具、方法和数据库等资源。 Mol Plant | 华中农大杨庆勇团队发布油菜群体变异数据库，架起基因型与表型的桥梁、助力油菜分子育种 BnVIR: bridging the geno 阅读全文
posted @ 2022-03-06 23:45 生物信息与育种 阅读(286) 评论(0) 推荐(0)
【动植物研究动态】2022年1-3月收藏的文献
摘要：【动植物研究动态】2022年1-3月收藏的文献 微信收藏夹中的文献解读，只整理出今年2022年已收藏的部分文献，之前的太多，不列了。后续计划每周更一次，自己会看得更认真点，解读更详细些。 Nature Genetics | 基因组重建为马铃薯育种改良开辟新途径 Chromosome-scale an 阅读全文
posted @ 2022-03-06 00:15 生物信息与育种 阅读(403) 评论(0) 推荐(0)
泛基因组分析方案
摘要：备注：本文主要来源于知乎《全新的泛基因组解决方案》。关于大豆泛基因组文章解读，请看往期记录《大豆(Soybean, Glycine max)泛基因组2020Cell》。 一、研究内容 泛基因组产品采用从头组装的策略进行泛基因组构建，分析内容包括比较基因组分析、核心基因和非必需基因分析、结构变异（SV 阅读全文
posted @ 2021-07-22 23:30 生物信息与育种 阅读(3564) 评论(0) 推荐(0)

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