小鲨鱼2018

2022年7月17日

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 1 01 2 02 3 AAA 4 03 5 04 6 03 7 BBB 8 06 9 07 10 BBB 11 0 阅读全文

posted @ 2022-07-17 21:50 小鲨鱼2018 阅读(722) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 sed命令匹配特定字符之间的数据

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 01 02 AAA 03 04 05 BBB 06 07 08 CCC 09 10 root@DESKTOP-1N4 阅读全文

posted @ 2022-07-17 21:26 小鲨鱼2018 阅读(1055) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 sed匹配特定字符并输出其后的若干行

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt ## 测试数据 01 1 02 2 AA 3 03 4 04 5 05 6 BB 7 06 8 07 9 AA 10 阅读全文

posted @ 2022-07-17 21:00 小鲨鱼2018 阅读(2217) 评论(0) 推荐(0)

2022年7月16日

plink 软件中 --allow-no-sex 参数的作用

摘要： --allow-no-sex：在进行关联分析时，缺失性别信息时，仍然进行分析。 001、缺失性别信息，同时不使用改参数时： root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls clean.bed clean.bim clean.fam root@DESKTOP-1N42TVH 阅读全文

posted @ 2022-07-16 23:15 小鲨鱼2018 阅读(820) 评论(0) 推荐(0)

2022年7月15日

gemma 软件对数量性状混合线性模型T值及P值的计算

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls gwas_test.bed gwas_test.bim gwas_test.fam root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# /home/software/gemma-0.98.5-linu 阅读全文

posted @ 2022-07-15 17:11 小鲨鱼2018 阅读(419) 评论(0) 推荐(0)

gemma 对数量性状一般线性模型关联分析计算 T值

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls gwas_test.bed gwas_test.bim gwas_test.fam root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# /home/software/gemma-0.98.5-linu 阅读全文

posted @ 2022-07-15 16:45 小鲨鱼2018 阅读(147) 评论(0) 推荐(0)

plink软件 --linear 对数量性状进行关联分析 SE计算

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls gwas_test.map gwas_test.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# plink --file gwas_test --linear --out test 1> 阅读全文

posted @ 2022-07-15 16:27 小鲨鱼2018 阅读(579) 评论(0) 推荐(0)

plink 软件 --assoc 数量性状关联分析 T值的来源

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls gwas_test.map gwas_test.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# plink --file gwas_test --assoc --out test 1> / 阅读全文

posted @ 2022-07-15 10:21 小鲨鱼2018 阅读(131) 评论(0) 推荐(0)

2022年7月14日

plink 软件中 --assoc （或 --linear）对数量性状进行关联分析中T检验，由T值计算p值验证

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls ## 测试数据 gwas_test.map gwas_test.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# plink --file gwas_test --assoc --out t 阅读全文

posted @ 2022-07-14 23:45 小鲨鱼2018 阅读(619) 评论(2) 推荐(0)

plink 软件中 --assoc 参数对二分类性状关联分析卡方值、及p值计算

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls ## 测试数据 gwas_test.map gwas_test.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# plink --file gwas_test --assoc --out t 阅读全文

posted @ 2022-07-14 23:21 小鲨鱼2018 阅读(433) 评论(0) 推荐(0)

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