小鲨鱼2018

2022年7月29日

摘要： 001、 r1 <- c("CC","CC","GG","TT") r2 <- c("GG","GG","GC","TT") r3 <- c("CC","GG","GG","TT") dat <- data.frame(r1, r2, r3) ## 测试数据框 dat gsub(pattern = 阅读全文

posted @ 2022-07-29 17:26 小鲨鱼2018 阅读(447) 评论(0) 推荐(0)

linux shell脚本实现 xx.hmp.txt格式数据转换为plink格式

摘要： 001、测试数据 root@PC1:/home/test# ls mdp_genotype_test.hmp.txt record.sh root@PC1:/home/test# head -n 5 mdp_genotype_test.hmp.txt | cut -f 1-13 ## 测试数据 rs 阅读全文

posted @ 2022-07-29 00:39 小鲨鱼2018 阅读(311) 评论(0) 推荐(0)

linux 中如何匹配非空字符

摘要： 001、\S：大写S root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt 33-16 CC CC GG TT GG TT GG TT CC 38-11 CC GG GG TT GG TT CC TT CC 4226 CC CC 阅读全文

posted @ 2022-07-29 00:09 小鲨鱼2018 阅读(200) 评论(0) 推荐(0)

2022年7月28日

R语言中expect_true函数

摘要： 001、 library(testthat) ## 函数属于testthat包 expect_true( 2 == 2) ## 在程序中用于判断条件是否成立 expect_true( 2 != 2) 阅读全文

posted @ 2022-07-28 18:51 小鲨鱼2018 阅读(139) 评论(0) 推荐(0)

标准误

摘要：标准误：即样本均数的标准差。标准误 = 标准差 / N的根号。是描述均数抽样分布的离散程度及衡量均数抽样误差大小的尺度，反映的是样本均数之间的变异。标准误不是标准差，是多个样本平均数的标准差。标准误用来衡量抽样误差。标准误越小，表明样本统计量与总体参数的值越接近，样本对总体越有代表性，用样本统阅读全文

posted @ 2022-07-28 11:53 小鲨鱼2018 阅读(1154) 评论(0) 推荐(0)

2022年7月27日

R语言中对数据框进行排序

摘要： 001、读取测试数据 dir() dat <- read.table("test.txt") dat 002、按照第一列进行升序排列 dat dat[order(dat[,1]),] 03、第一例按照降序进行排序 dat[order(-dat[,1]),] 004、第一列升序、第二列降序 dat[o 阅读全文

posted @ 2022-07-27 22:51 小鲨鱼2018 阅读(3684) 评论(0) 推荐(0)

R语言中inner_join、left_join、right_join、full_join函数

摘要： 001、测试数据 library(dplyr) class1 <- tribble( ~'名次',~'姓名', '第一名','王某人', '第二名','张周人', '第三名','李某人' ) class2 <- tribble( ~'名次',~'姓名', '第一名','胡某人', '第二名','刘周阅读全文

posted @ 2022-07-27 22:09 小鲨鱼2018 阅读(6278) 评论(0) 推荐(1)

R语言中如何删除重复行

摘要： 001、测试数据 root@PC1:/home/test3# ls test.gff root@PC1:/home/test3# cat test.gff ## 测试数据 a b c e j j a b c i j k a b c x y z i q m x y z i e i 002、unique 阅读全文

posted @ 2022-07-27 21:44 小鲨鱼2018 阅读(6101) 评论(0) 推荐(0)

R语言中如何读取带有#注释的数据

摘要： 001、测试数据 root@PC1:/home/test3# ls test.gff root@PC1:/home/test3# cat test.gff ## 1 aa bb xx yy ## 2 jj kk uu ss ee 3 mm jj aa ww ff 4 ee ww qq kk ee 5 阅读全文

posted @ 2022-07-27 21:26 小鲨鱼2018 阅读(469) 评论(0) 推荐(0)

R语言读取数据如何跳过文件的前几行

摘要： 001、测试数据 root@PC1:/home/test3# ls test.gff root@PC1:/home/test3# cat test.gff 1 aa bb xx yy 2 jj kk uu ss 3 mm jj aa ww 4 ee ww qq kk 5 xx ff ee jj di 阅读全文

posted @ 2022-07-27 21:16 小鲨鱼2018 阅读(1725) 评论(0) 推荐(0)

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