橙子牛奶糖

摘要： GWAS研究中经常涉及到基因座（locus）的概念，下面简要介绍一下批量注释基因到基因座的方法。 1、单个基因注释到基因座 对于单个基因的基因座注释，比较简单，常用的工具有：UCSC Genome Browser、NCBI。 比如UCSC Genome Browser： 还有NCBI： 2、批量注释 阅读全文

摘要： 运行以下命令时： ego.down <- enrichGO(gene = down$newid, universe = bg.list$newid, OrgDb = org.Hs.eg.db, keyType = 'ENSEMBL', ont = "BP", # biological process 阅读全文

摘要： 害，超算不能联网，所有东西只能本地安装。 tar -zxvf pyBigWig-0.3.18.tar.gz cd pyBigWig-0.3.18/ python setup.py install 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20210822 一、精细解读文献 一 文献题目： Multi-omics integration analysis identifies novel genes for alcoholism with potential overlap with neurodegenerative 阅读全文

摘要： 使用命令df = OG %>% group_by(Gene,Domain) %>% summarise(count()) 出现如下报错： Error: Problem with `summarise()` input `..1`. i `..1 = count()`. x no applicable 阅读全文

摘要： 如下所示，表面上activate成功了（由base变成r4-base），但实际上调用的还是默认路径下的r(/usr/bin/r)，而我期待给出的结果是/home/wenyan/anaconda3/envs/r4-base/bin/r (base) wenyan@dell$ conda activat 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20210815 一、精细解读文献 一 文献题目： Rare variant contribution to human disease in 281,104 UK Biobank exomes 不想看英文题目： 281,104 例 UK Biobank 外显子组中罕见变异对人类疾病 阅读全文

摘要： 跑以下命令时报错： QTLtools cis --vcf file.vcf.gz --bed file.bed.gz --cov covariate.txt --permute 10000 --grp-best --window 100000 --out permutations.txt 其中，纳入 阅读全文

摘要： 1 确保基因型，表型，协变量的样本名完全一致： 比如我的基因型和表型样本名如下所示： 但我的协变量样本名如下所示： 别问为什么协变量样本名由-变为., 问就是R的锅 阅读全文

摘要： 1 下载、安装、编译 QTLtools 下载、解压 QTLtools： wget https://qtltools.github.io/qtltools/binaries/QTLtools_1.3.1_source.tar.gz tar xzvf QTLtools_1.3.1_source.tar. 阅读全文