橙子牛奶糖

摘要： 卡方检验（chi-square test）：独立性检验，判断变量之间是否有相关性； 费歇尔精确检验（fisher's exact test）：同样为独立性检验，但基于超几何分布； 什么情况下用卡方检验（chi-square test）或费歇尔精确检验（fisher's exact test）呢？ 以 阅读全文

摘要： 如下代码所示： data <- dat %>% arrange(desc(count)) #按照count一列降序排序 #data <- dat %>% arrange(count) #按照count一列升序排序 data$trait<-factor(data$trait,levels = uniq 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20211212 一、精细解读文献 一 文献题目： Common and rare variant association analyses in amyotrophic lateral sclerosis identify 15 risk loci with distinct ge 阅读全文

摘要： 如下图所示： 阅读全文

摘要： 现在有文件file.txt, 如下所示： header1 header2 chr10_10000018 chr11 chr10_10000018 chr12 chr10_100000625 chr10 chr10_100000645 chr11 chr10_100001867 chr11 可以看到， 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20211205 一、精细解读文献 一 文献题目： Large-scale integration of the plasma proteome with genetics and disease 不想看英文题目： 血浆蛋白质组、基因组、疾病的大规模整合分析 杂志和影响因子： Nat 阅读全文

摘要： sentinel SNP：在 GWAS 中，P 值最显著的 SNP; Tag Snp：在给定的 SNP 中，连锁不平衡值（LD）最高的 SNP; 相关讨论：https://www.biostars.org/p/11786/ 阅读全文

摘要： 鉴于太多人问我怎么批量根据chr:pos查找RS号，在这里出一个教程。 注意以下教程展示的是修改hg19基因组版本的RS号，如果你的数据是其他版本的，请修改为对应版本的数据。 假定数据是test.txt，内容如下： 现在希望根据第一列chr:pos找到对应的RS号，实现以下的效果： 则可以用dply 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20211128 一、精细解读文献 一 文献题目： Deep learning enables genetic analysis of the human thoracic aorta 不想看英文题目： 基于深度学习的人类胸主动脉遗传学分析 杂志和影响因子： Nat Genet (I 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20211121 一、精细解读文献 一 文献题目： COVID-19 genetic risk variants are associated with expression of multiple genes in diverse immune cell types 不想看英文题目 阅读全文