橙子牛奶糖

摘要： 1. 人类基因组转录起始位点 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 阅读全文

摘要： 给大家推荐一个基因-药物相互作用数据库 DGIdb (网址：https://www.dgidb.org/) 该网站主要有两个功能： 1）可通过输入基因查找相互作用的药物； 2）通过输入药物查找相互作用的基因。 1、通过基因查找相互作用的药物 使用起来非常简单，只要输入基因名，就可以得到与基因相互作用 阅读全文

摘要： 本周末博主要找房子和搬家，故提前发本周的文献速递推文； 一 文献题目： Interpreting type 1 diabetes risk with genetics and single-cell epigenomics 不想看英文题目： 利用遗传学和单细胞表观基因组学解析1型糖尿病的风险 杂志和 阅读全文

摘要： 跑metaxcan时遇到报错提示：AttributeError: Can only use .str accessor with string values! 仔细排查，发现是输入文件分隔符的问题。 我的输入文件分隔符是空白分隔符，而metaxcan要求输入文件分隔符必须是tab 因此，重新生成输出 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20210516 一 文献题目： Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome 不想看英文题目： 人类基因组中等位基因特异性转录因子结合图谱 杂志和影响因子： Nat Com 阅读全文

摘要： file文件如下： 想实现第8列和第9列相加，则直接$8+$9即可实现： awk ' {print $1,$2,$3,$4,$5,$6,$7,$8,$9,$8+$9,$10,$11,$12,$13,$14,$15,$16,$17}' test 效果如下： 阅读全文

摘要： 现有文件 file 如下所示： 想利用awk将这一列转为一行，并且分隔符为双引号和逗号； 用如下命令实现： awk '{printf $0"\",\""}' file 得到如下结果： 阅读全文

摘要： 看文献时，翻到一张保守性得分图： 图片来源：Reducing the structure bias of RNA-Seq reveals a large number of non-annotated non-coding RNA 原文描述：As expected, the most conserv 阅读全文

摘要： file文件如下所示： 任务1：提取所有列数为7的行 awk '{if(NF==7) print $0}' file > filecol7 生成的filecol7如下所示： 任务2：提取所有列数不为7的行 awk '{if(NF!=7) print $0}' file > fileno7 生成的fi 阅读全文

摘要： 本周最新文献速递20210509 一 文献题目： Neuronal ApoE upregulates MHC-I expression to drive selective neurodegeneration in Alzheimer's disease 不想看英文题目： 神经元ApoE上调MHC- 阅读全文