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1. 简介 X!Tandem是GPM:The Global Proteome Machine(主要基于Web的开源用户界面,用于分析和显示蛋白质鉴定数据。关于GPM的更多内容可参考https://www.thegpm.org/GPM/faq.html)中的一个成员,此外还有X! P3 、X! Hun 阅读全文
posted @ 2020-08-28 09:38
生物信息与育种
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遗传咨询简介 遗传疾病——专业知识——风险评估——沟通技巧——技术支持 咨询师工作流程 肿瘤基因检测 肿瘤发生的根本原因是基因突变 突变累积 一般发生到恶化要10年左右 样本类型和变异来源 约5%-10%的肿瘤与遗传基因有关,不同癌种略有不同(如卵巢癌20%以上) 多数遗传性肿瘤为常染色体显性遗传, 阅读全文
posted @ 2020-08-28 09:31
生物信息与育种
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解读相关专业术语 2个概念:胚系、体系突变 4种变异类型:SNV、Indel、融合/SV(大的易位/倒位/缺失)、CNV 2个免疫指标:TMB、MSI 3个权威机构指南:FDA(美国食品药品监管局)、NMPA(国家药品监管局)、NCCN(肿瘤学临床实践指南) 体系变异解读规则 癌症变异解读指南和标准 阅读全文
posted @ 2020-08-28 09:29
生物信息与育种
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遗传性肿瘤简介 遗传性肿瘤综合征:由于遗传性原因导致的染色体和基因异常,造成系统性肿瘤患病几率大大增加 germline variant:存在所有细胞中 somatic mutation:仅存在肿瘤细胞中 多数遗传性肿瘤为常染色体显性遗传(AD遗传):父母的致病突变有50%概率遗传给后代,外显不全( 阅读全文
posted @ 2020-08-28 09:28
生物信息与育种
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导论 表观遗传:非DNA决定的基因表达,或表型改变中可遗传因素的研究 DNA水平:甲基化(胞嘧啶(二代测序为主)5mC,腺嘌呤(三代为主)6mA,羟甲基化 RNA水平:甲基化,ncRNA 染色质水平:组蛋白修饰(甲基化/乙酰化/磷酸化/泛素化),核小体定位,染色质重塑和构象 DNA甲基化被广泛的应用 阅读全文
posted @ 2020-08-28 09:26
生物信息与育种
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