小鲨鱼2018

2022年10月14日

摘要： 001、 [root@pc1 test3]# ls test.txt [root@pc1 test3]# cat test.txt ## 测试数据 addg ad adfgg d dfg [root@pc1 test3]# awk '{print length}' test.txt 4 2 5 1 阅读全文

posted @ 2022-10-14 09:41 小鲨鱼2018 阅读(1223) 评论(0) 推荐(0)

centos7 中manta软件的安装

摘要： 001、系统 (base) [root@pc1 ~]# cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.6.1810 (Core) 002、安装必须环境模块 yum install -y tar bzip2 make gcc gcc-c++ libstd 阅读全文

posted @ 2022-10-14 08:42 小鲨鱼2018 阅读(170) 评论(0) 推荐(0)

2022年10月12日

如何检测bam文件的完整性

摘要： 001、 [root@pc1 test]# ls E_coli_K12.sorted.markdup.bam ## 测试bam文件 [root@pc1 test]# samtools quickcheck E_coli_K12.sorted.markdup.bam ## 使用samtools qui 阅读全文

posted @ 2022-10-12 12:07 小鲨鱼2018 阅读(1426) 评论(0) 推荐(0)

2022年10月10日

关闭anaconda3 默认自动启动的命令

摘要： 001、 conda config --set auto_activate_base false 阅读全文

posted @ 2022-10-10 11:40 小鲨鱼2018 阅读(381) 评论(0) 推荐(0)

github.com[0: 192.30.255.113]: errno=Connection refused

摘要： 001、问题 002、解决方法，将git改为https 阅读全文

posted @ 2022-10-10 10:18 小鲨鱼2018 阅读(116) 评论(0) 推荐(0)

centos7 中安装java8

摘要：使用yum安装 001、查看安装包 [root@localhost test]# cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.9.2009 (Core) 002、查看java8安装包 [root@localhost test]# yum list j 阅读全文

posted @ 2022-10-10 09:48 小鲨鱼2018 阅读(1883) 评论(0) 推荐(1)

configure: error: HTSlib development files not found

摘要： 001、问题 configure: error: HTSlib development files not found 002、解决方法，安装htslib wget https://github.com/samtools/htslib/releases/download/1.16/htslib-1. 阅读全文

posted @ 2022-10-10 09:28 小鲨鱼2018 阅读(270) 评论(0) 推荐(0)

configure: error: htscodecs submodule files not present.

摘要： 001、问题 configure: error: htscodecs submodule files not present. 002、解决方法，从官方从新下载:https://www.htslib.org/download/ 重新下载，解压，编译可以解决上面的问题。阅读全文

posted @ 2022-10-10 09:17 小鲨鱼2018 阅读(292) 评论(0) 推荐(0)

utils.c:33:18: fatal error: zlib.h: No such file or directory

摘要： 001、问题 utils.c:33:18: fatal error: zlib.h: No such file or directory 002、解决方法 yum install zlib-devel 参考：https://www.cnblogs.com/ltaodream/p/16089098.h 阅读全文

posted @ 2022-10-10 08:26 小鲨鱼2018 阅读(151) 评论(0) 推荐(0)

2022年10月9日

perl中安装 GD/Graph/histogram

摘要： 001、 cpanm GD::Graph::histogram 阅读全文

posted @ 2022-10-09 10:56 小鲨鱼2018 阅读(204) 评论(0) 推荐(0)

公告