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001、 问题 >>> from Bio import SeqIO 002、解决方法 pip3 install biopython -i https://pypi.douban.com/simple 003、测试效果 from Bio import SeqIO 阅读全文
posted @ 2022-11-19 22:57
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001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt test.py [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试序列 AGCTTCCCC [root@pc1 test2]# cat test.py ## 测试程序 #!/usr/bin/python in_file 阅读全文
posted @ 2022-11-16 18:21
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001、 [root@pc1 test3]# ls a.txt [root@pc1 test3]# cat a.txt ## 测试数据 ad_33;hh_kk dd;ff;dd;77 uu_77_88_99 [root@pc1 test3]# awk -F "[_;]" '{print $2}' a 阅读全文
posted @ 2022-11-16 18:02
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001、match >>> import re >>> str1 = "www.baidu.com" ## 测试字符串 >>> re.match("www", str1) <re.Match object; span=(0, 3), match='www'> >>> re.match("www", 阅读全文
posted @ 2022-11-16 16:21
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001、shell实现 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 1 4 6 10 8 16 17 20 [root@pc1 test2]# cat a.txt | tr " " "\n" | sed -e '1d' 阅读全文
posted @ 2022-11-16 14:41
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001、shell实现 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 a 8 b 3 a 9 a 2 b 3 c 7 c 2 c 10 [root@pc1 test2]# for i in a b c; do grep 阅读全文
posted @ 2022-11-16 11:16
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001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 ab cd kk jj ee rr tt tt ss nn bb rr [root@pc1 test2]# rev a.txt | sed 's/ /_/' | r 阅读全文
posted @ 2022-11-16 10:29
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001、 >>> list1 = [("aa",100, 400), ("bb", "kk", "yy"), (33, 400, 500)] >>> for i, j, k in list1: ## 利用列表、元组同时传入多个参数 ... print(i,k) ... aa 400 bb yy 33 阅读全文
posted @ 2022-11-15 23:45
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001、 直接使用字典进行统计 >>> str1 = "aaaabbcdddefff" ## 测试字符串 >>> dict1 = dict() >>> for i in str1: ## 利用条件分支进行判断 ... if i in dict1: ... dict1[i] += 1 ... else 阅读全文
posted @ 2022-11-15 23:34
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首先，defaultdict 是 dict 的一个子类。通常 Python 中字典(dict)是通过键值对来存取的，当索引一个不存在的键时，就会引发 keyerror 异常。那么，defaultdict 就可以解决这个问题，它可以实现为不存的键值返回一个默认值。 defaultdict是 colle 阅读全文
posted @ 2022-11-15 23:24
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