小鲨鱼2018

2022年10月27日

摘要： 001、 [root@pc1 test]# cat a.fa >chr1 aatt cc >chr2 ttgg ccgg >chr3 aa [root@pc1 test]# cat test.py #!/usr/bin/python in_file = open("a.fa", "r") dict1 阅读全文

posted @ 2022-10-27 23:22 小鲨鱼2018 阅读(56) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 shell 统计每条scaffold的长度

摘要： 001、 [root@pc1 test]# ls a.fa [root@pc1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aatt cc >chr2 ttgg ccgg >chr3 aa [root@pc1 test]# awk '{if($0 ~ /^>/) {prin 阅读全文

posted @ 2022-10-27 23:11 小鲨鱼2018 阅读(56) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 wc -c命令

摘要： 001、统计字符数（包括空格和换行符） [root@pc1 test]# ls a.txt [root@pc1 test]# cat a.txt ## 测试文件 ad t d [root@pc1 test]# wc -c a.txt ## wc -c命令统计字符数，包含换行符和空格 7 a.txt 阅读全文

posted @ 2022-10-27 22:53 小鲨鱼2018 阅读(1100) 评论(0) 推荐(0)

linux 系统中如何判断字符串是否相同

摘要： 001、 [b20223040323@admin1 test2]$ ls test.sh [b20223040323@admin1 test2]$ cat test.sh ## 测试脚本 #!/bin/bash a="abc" b="abc" if [ $a == $b ] then echo "i 阅读全文

posted @ 2022-10-27 18:51 小鲨鱼2018 阅读(308) 评论(0) 推荐(0)

2022年10月26日

linux 中如何删除特定字符之间的数据

摘要： 001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 j d e w e th d e s d g e t f g w e t [root@pc1 test2]# sed 's/e.*e//' a.txt ## 删除e 阅读全文

posted @ 2022-10-26 22:46 小鲨鱼2018 阅读(316) 评论(0) 推荐(0)

linux 中如何统计某一目录下一类文件总的大小

摘要： 001、 [root@pc1 test]# ls a.csv a.txt b.csv b.txt c.csv [root@pc1 test]# ll -h ## 测试文件 total 430M -rw-r--r--. 1 root root 20M Oct 26 18:02 a.csv -rw-r- 阅读全文

posted @ 2022-10-26 18:07 小鲨鱼2018 阅读(170) 评论(0) 推荐(0)

2022年10月24日

linux中删除文本的最后一行

摘要： 001、 [root@pc1 test]# ls test.txt [root@pc1 test]# cat test.txt 1 2 3 4 5 [root@pc1 test]# sed "$d" test.txt 1 2 3 4 5 [root@pc1 test]# sed '$d' test. 阅读全文

posted @ 2022-10-24 08:36 小鲨鱼2018 阅读(1657) 评论(0) 推荐(0)

2022年10月21日

linux shell中利用关键字批量移动或复制文件

摘要： 001、 [root@localhost test3]# ls a34 a45 b34 b54 c23 c34 dirab [root@localhost test3]# tree . ├── a34 ├── a45 ├── b34 ├── b54 ├── c23 ├── c34 └── dirab 阅读全文

posted @ 2022-10-21 18:17 小鲨鱼2018 阅读(363) 评论(0) 推荐(0)

AttributeError: module 'importlib._bootstrap_external' has no attribute '_w_long'

摘要： 001、问题 AttributeError: module 'importlib._bootstrap_external' has no attribute '_w_long' 002、原因 pip版本和对应的python调用不是同一个版本 003、解决方法查找环境变量，将pip命令和pytho 阅读全文

posted @ 2022-10-21 17:33 小鲨鱼2018 阅读(1881) 评论(0) 推荐(0)

ModuleNotFoundError: No module named '_sqlite3'

摘要： 001、问题 ModuleNotFoundError: No module named '_sqlite3' 002、问题原因’ 安装python的时候没有找到sqlite3.so的库。 003、解决方法 yum install sqlite* 004、然后重新编译python3 ./configu 阅读全文

posted @ 2022-10-21 16:57 小鲨鱼2018 阅读(983) 评论(0) 推荐(0)

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