小鲨鱼2018

2023年4月28日

摘要： 001、官网：https://subread.sourceforge.net/ 下载： 02、解压 tar -xzvf subread-2.0.5-Linux-x86_64.tar.gz 03、进入以下目录： cd subread-2.0.5-Linux-x86_64/ 04、调用测试 ./fea 阅读全文

posted @ 2023-04-28 21:20 小鲨鱼2018 阅读(726) 评论(0) 推荐(0)

/usr/bin/env: ‘python’: No such file or directory

摘要： 01、问题 02、解决方法 a、 root@DESKTOP-A31BQ38:/home/software/gatk-4.4.0.0# which python3 ## 确定已经安装python; 或者执行 which python，输出python可调用路径 /usr/bin/python3 b、阅读全文

posted @ 2023-04-28 21:03 小鲨鱼2018 阅读(663) 评论(0) 推荐(0)

tar (child): bzip2: Cannot exec: No such file or directory

摘要： 01、问题 02、ubuntu系统 root@DESKTOP-A31BQ38:/home/software# lsb_release -a 03、解决方法 root@DESKTOP-A31BQ38:/home/software# apt install bzip2 参考：https://blog.c 阅读全文

posted @ 2023-04-28 20:38 小鲨鱼2018 阅读(363) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月27日

R语言中数据框除以向量

摘要： R语言中数据框除以向量，规则是数据框中的元素按照列依次递增，除数向量循环递增。 001、 a <- c(20, 10, 6, 8) b <- c(2, 4, 12, 8) c <- c(6, 8, 14, 14) dat <- data.frame(a, b, c) dat idx <- c(2, 阅读全文

posted @ 2023-04-27 16:47 小鲨鱼2018 阅读(151) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月26日

linux 中批量提取指定的列

摘要： 001、 (py38) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# ls a.txt index.txt record.sh (py38) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 阅读全文

posted @ 2023-04-26 15:05 小鲨鱼2018 阅读(138) 评论(0) 推荐(0)

linux 中实现批量删除指定的列

摘要： 001、 (py38) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# ls a.txt index.txt record.sh (py38) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 阅读全文

posted @ 2023-04-26 14:54 小鲨鱼2018 阅读(197) 评论(0) 推荐(0)

DESeq2包安装

摘要： 001、 library(BiocManager) BiocManager::install("DESeq2") 阅读全文

posted @ 2023-04-26 11:43 小鲨鱼2018 阅读(676) 评论(0) 推荐(0)

R语言中aggregate实现对数据框按照指定列对重复项进行合并

摘要： 001、 c1 <- c("a", "b", "a", "a", "b", "c") c2 <- c(3, 1, 4, 7, 8, 2) dat <- data.frame(c1, c2) ## 测试数据框 dat aggregate(dat$c2, by=list(dat$c1), sum) ## 阅读全文

posted @ 2023-04-26 10:21 小鲨鱼2018 阅读(343) 评论(0) 推荐(0)

R语言中 column_to_rownames 函数实现将数据框中任一列转换为行名

摘要： 001、 library(tidyverse) ## 加载包 a <- c(3, 5, 2, 1) b <- letters[1:4] c <- LETTERS[1:4] dat <- data.frame(a, b, c) dat column_to_rownames(dat, "a") ## 将阅读全文

posted @ 2023-04-26 10:15 小鲨鱼2018 阅读(11985) 评论(0) 推荐(0)

R语言中aggregate 函数

摘要： 001、测试数据框 studentID <- seq(1, 20) gender <- rep(c("M", "M", "F", "F", "F"), 4) math <- rep(c(92, 86, 85, 74, 82), 4) english <- rep(c(76, 69, 82, 71, 阅读全文

posted @ 2023-04-26 09:49 小鲨鱼2018 阅读(336) 评论(0) 推荐(0)

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