小鲨鱼2018

2023年4月21日

摘要： 001、 (base) [b20223040323@admin1 test2]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin1 test2]$ cat a.txt ## 测试数目 6 8 9 3 7 5 2 5 6 8 8 2 4 2 7 (base) [b2022304 阅读全文

posted @ 2023-04-21 21:13 小鲨鱼2018 阅读(59) 评论(0) 推荐(0)

linux 中实现按照行压缩连续的重复

摘要： 001、 (base) [b20223040323@admin1 test2]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin1 test2]$ cat a.txt ## 测试数据 er kj ab ab ab jk ab ab uy dd xy xy xy xy xy m 阅读全文

posted @ 2023-04-21 21:02 小鲨鱼2018 阅读(23) 评论(0) 推荐(0)

linux 中截取文本的最后几个字符

摘要： 001、rev + cut -c实现 (base) [b20223040323@admin1 test]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin1 test]$ cat a.txt ## 测试数据 iuwe sdfdsf 2343 8dsfdj saff 32435 阅读全文

posted @ 2023-04-21 15:31 小鲨鱼2018 阅读(206) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月20日

linux 中安装 Htseq-count 软件

摘要： 001、下载安装源代码 wget https://pypi.python.org/packages/fd/94/b7c8c1dcb7a3c3dcbde66b8d29583df4fa0059d88cc3592f62d15ef539a2/HTSeq-0.9.1.tar.gz#md5=fc71e021bf 阅读全文

posted @ 2023-04-20 10:41 小鲨鱼2018 阅读(1070) 评论(0) 推荐(0)

gcc: fatal error: cannot execute ‘cc1plus’: execvp: No such file or directory

摘要： 01、安装 HTSeq软件出现如下报错，编译失败 02、原因是没有c++编译器，解决方法： apt install g++ ## 安装c++编译器 03、再次安装HTseq，报错消失。阅读全文

posted @ 2023-04-20 10:23 小鲨鱼2018 阅读(2899) 评论(0) 推荐(0)

linux 中安装 RSeQC 软件

摘要： 001、ubuntu系统 (base) root@DESKTOP-IDT9S0E:~# lsb_release -a No LSB modules are available. Distributor ID: Ubuntu Description: Ubuntu 20.04.5 LTS Releas 阅读全文

posted @ 2023-04-20 09:29 小鲨鱼2018 阅读(327) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月19日

使用conda 安装 hisat2 软件

摘要： 001、系统 root@DESKTOP-IDT9S0E:~# lsb_release -a No LSB modules are available. Distributor ID: Ubuntu Description: Ubuntu 20.04.5 LTS Release: 20.04 Code 阅读全文

posted @ 2023-04-19 16:17 小鲨鱼2018 阅读(2454) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月18日

从国家基因组科学数据中心下载数据

摘要： 001、官方网站：https://ngdc.cncb.ac.cn/ 002、入口： 003、输入数据编号： 004、 005、 06、 linux下载说明阅读全文

posted @ 2023-04-18 15:17 小鲨鱼2018 阅读(1352) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月15日

linux中sed命令删除首次匹配字符及其之前的内容或者指定匹配字符及其之前的内容

摘要： 001、删除首次匹配字符及其之前的内容 root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test/test/test# ls a.txt root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test/test/test# cat a.txt ## 测试数据 awQQrQQ24QQ34QQr5 阅读全文

posted @ 2023-04-15 22:37 小鲨鱼2018 阅读(3284) 评论(0) 推荐(0)

linux中截取字符串中指定字符之前的内容

摘要： 001、 root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test/test/test# str1="Homo_sapiens.GRCh38.99.chgffromosome.22.gff3" root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test/test/test# str2=${ 阅读全文

posted @ 2023-04-15 22:13 小鲨鱼2018 阅读(466) 评论(0) 推荐(0)

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