小鲨鱼2018

2023年4月24日

摘要： 001、 pip install multiqc 002、测试版本 multiqc --version 阅读全文

posted @ 2023-04-24 16:04 小鲨鱼2018 阅读(274) 评论(0) 推荐(0)

摘要： 001、 conda install -c bioconda iqtree 002、查看版本 iqtree --version 阅读全文

posted @ 2023-04-24 15:48 小鲨鱼2018 阅读(964) 评论(0) 推荐(0)

摘要： 001、 conda install -c bioconda mafft 002、查看版本 (base) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# mafft --version v7.310 (2017/Mar/17) 阅读全文

posted @ 2023-04-24 15:46 小鲨鱼2018 阅读(435) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月23日

plink 软件中 --set-missing-var-ids参数实现对缺失的snp位点命名

摘要： 001、测试数据 (base) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# ls a.map a.ped (base) root@DESKTOP-IDT9S0E:/home/test# cat a.map 1 OAR19_64675012.1 0 85204 1 OAR19_6 阅读全文

posted @ 2023-04-23 00:27 小鲨鱼2018 阅读(297) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月21日

linux 中实现数据的每一行进行排序

摘要： 001、 (base) [b20223040323@admin1 test2]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin1 test2]$ cat a.txt ## 测试数目 6 8 9 3 7 5 2 5 6 8 8 2 4 2 7 (base) [b2022304 阅读全文

posted @ 2023-04-21 21:13 小鲨鱼2018 阅读(56) 评论(0) 推荐(0)

linux 中实现按照行压缩连续的重复

摘要： 001、 (base) [b20223040323@admin1 test2]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin1 test2]$ cat a.txt ## 测试数据 er kj ab ab ab jk ab ab uy dd xy xy xy xy xy m 阅读全文

posted @ 2023-04-21 21:02 小鲨鱼2018 阅读(20) 评论(0) 推荐(0)

linux 中截取文本的最后几个字符

摘要： 001、rev + cut -c实现 (base) [b20223040323@admin1 test]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin1 test]$ cat a.txt ## 测试数据 iuwe sdfdsf 2343 8dsfdj saff 32435 阅读全文

posted @ 2023-04-21 15:31 小鲨鱼2018 阅读(198) 评论(0) 推荐(0)

2023年4月20日

linux 中安装 Htseq-count 软件

摘要： 001、下载安装源代码 wget https://pypi.python.org/packages/fd/94/b7c8c1dcb7a3c3dcbde66b8d29583df4fa0059d88cc3592f62d15ef539a2/HTSeq-0.9.1.tar.gz#md5=fc71e021bf 阅读全文

posted @ 2023-04-20 10:41 小鲨鱼2018 阅读(1036) 评论(0) 推荐(0)

gcc: fatal error: cannot execute ‘cc1plus’: execvp: No such file or directory

摘要： 01、安装 HTSeq软件出现如下报错，编译失败 02、原因是没有c++编译器，解决方法： apt install g++ ## 安装c++编译器 03、再次安装HTseq，报错消失。阅读全文

posted @ 2023-04-20 10:23 小鲨鱼2018 阅读(2838) 评论(0) 推荐(0)

linux 中安装 RSeQC 软件

摘要： 001、ubuntu系统 (base) root@DESKTOP-IDT9S0E:~# lsb_release -a No LSB modules are available. Distributor ID: Ubuntu Description: Ubuntu 20.04.5 LTS Releas 阅读全文

posted @ 2023-04-20 09:29 小鲨鱼2018 阅读(313) 评论(0) 推荐(0)

公告