2025年6月27日
fasta转换为phylip格式单样本一行
摘要： 001、 from Bio import AlignIO alignment = AlignIO.read("input.fasta", "fasta") AlignIO.write(alignment, "output.phy", "phylip-sequential") 。 阅读全文
posted @ 2025-06-27 19:25 小鲨鱼2018 阅读(17) 评论(0) 推荐(0)
线粒体基因组数据构建 network
摘要： 001、原始fasta格式数据的多序列比对 mafft --auto --thread 4 all_460_trim02.fasta > aligned_sequences.fasta 002、fasta格式数据转换为phy格式 DNAsp软件实现： 003、network软件计算： 004、 00 阅读全文
posted @ 2025-06-27 16:56 小鲨鱼2018 阅读(13) 评论(0) 推荐(0)