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### 1 打印1-100 ``` for i in `seq 001 100` do echo $i done ``` 打印效果： 
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原始数据df1如下所示，ID=3有重复行，对于重复的行，则合并列。 ID Val1 Val2 Val3 0 2 3 4 1 5 3 2 2 3 4 3 3 **4** 5 9 3 **2** 5 9 变成如下所示： ID Val1 Val2 Val3 0 2 3 4 1 5 3 2 2 3 4 3 阅读全文
posted @ 2023-08-17 18:32
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基因型比值比（genotypic odds ratio）和等位基因比值比（allelic odds ratio）是两个不同的概念。一般而言，通过PLINK、GCTA等工具计算得到的比值比指的是等位基因比值比。 以下是基因型比值比和等位基因比值比的各自计算公式。假设有`a/a`，`A/a`，`A/A` 阅读全文
posted @ 2023-08-14 21:51
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linux 用sort+uniq虽然可以去重，但是会改动原文件行的顺序。 因此可以用`awk '!x[$0]++' file.txt > sort.txt`命令 `'!x[$0]++'`可以在去重的基础上，不改动原来文件的行顺序。 阅读全文
posted @ 2023-07-21 18:30
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运行命令`${src}/cuffmerge -o ./merge -g ${input}/gencode.v44.primary_assembly.annotation_sorted.gtf merge.list`时报错： >run_log = open(logging_dir + "run.log 阅读全文
posted @ 2023-07-21 14:55
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 >https://life-epigenetics-methylprep.readthedocs-host 阅读全文
posted @ 2023-07-12 18:49
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GWAS表型的标准化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization、Z-score normalization等。 各自区别如下： ## 一、Quantile normalization 该方法将每个样本中表型值进行排序，然后将其规范化到 阅读全文
posted @ 2023-06-20 22:00
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协变量格式如下所示：  注意事项： * 缺失值用NA表示； * 接受定性和定量的协变量； * **定量**协变量用数值型 阅读全文
posted @ 2023-05-24 18:46
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 The top panel shows all of the genes in the locus. The marg 阅读全文
posted @ 2023-05-22 18:59
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升级了dplyr后运行命令inter=inter %>% rename("gene"="V4") 就一直报错：Some 'from' names in value not found on 'x'，如下所示： Error in rename(., gene = "V4") : Some 'from' 阅读全文
posted @ 2023-04-14 21:03
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