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摘要: plink --bfile file --extract all.snp --r2 --ld-window-kb 1000 --ld-window-r2 0.8 --ld-snp-list all.snp --out all.snp.08.inter all.snp文件如下所示: 阅读全文
posted @ 2022-04-21 15:03 橙子牛奶糖 阅读(2860) 评论(0) 推荐(0)
摘要: # source activate perl cpanm Math::GSL::SF --force 阅读全文
posted @ 2022-04-20 10:38 橙子牛奶糖 阅读(300) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 解决办法:conda install gxx_linux-64 阅读全文
posted @ 2022-04-20 09:54 橙子牛奶糖 阅读(1674) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 生成数据: library(dplyr) set.seed(1) df <- expand.grid(list(A = 1:5, B = 1:5, C = 1:5)) df$value <- runif(nrow(df)) 情况 1:group_by + summarise df %>% group 阅读全文
posted @ 2022-04-19 11:02 橙子牛奶糖 阅读(1245) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 本周最新文献速递20220410 一、精细解读文献 一 文献题目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic biology in schizophrenia 不想看英文题目: 解析精神分裂症的易感基因和突触生物学 杂志和影响因子: Nat 阅读全文
posted @ 2022-04-10 23:05 橙子牛奶糖 阅读(286) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 跑命令fastqtl2mash-docker sos run /path/fastqtl_to_mash.ipynb --data_list /path/FastQTLSumStats.list --gene_list /path/mashr/GTEx_genes.txt --cols 3 4 5 阅读全文
posted @ 2022-04-06 15:08 橙子牛奶糖 阅读(93) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 如下图所示: 第一列和第二列在好多行中重复了,现只想保留非重复的行:达到以下目的: 则可以使用以下命令: sort test -k 1,2 | awk '!i[$1,$2]++' > test1 阅读全文
posted @ 2022-03-31 18:20 橙子牛奶糖 阅读(605) 评论(0) 推荐(1)
摘要: 本周最新文献速递20220327 一、精细解读文献 一 文献题目: Genetic regulation of post-translational modification of two distinct proteins 不想看英文题目: 两种不同蛋白质翻译后修饰的遗传调控模式 杂志和影响因子: 阅读全文
posted @ 2022-03-27 16:21 橙子牛奶糖 阅读(199) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 本周最新文献速递20220320 一、精细解读文献 一 文献题目: Genetic associations at regulatory phenotypes improve fine-mapping of causal variants for 12 immune-mediated disease 阅读全文
posted @ 2022-03-20 19:05 橙子牛奶糖 阅读(448) 评论(0) 推荐(1)
摘要: 本周最新文献速递20220313 一、精细解读文献 一 文献题目: Prediction of histone post-translational modification patterns based on nascent transcription data 不想看英文题目: 基于新生转录数据 阅读全文
posted @ 2022-03-13 13:09 橙子牛奶糖 阅读(296) 评论(0) 推荐(0)
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