橙子牛奶糖

摘要： 1、安装bioconductor及go分析涉及的相关包 在这一步经常出现以下报错： 报错类型1：Warning message: In file(filename, "r", encoding = encoding) : InternetOpenUrl failed: '操作超时'。 这类报错的解决 阅读全文

摘要： 'y'必需是数值矢量，产生该类报错可能是含有NA值。 只需要在该数值上加入as.double函数即可。见下命令： 阅读全文

摘要： 存在file1.txt 1 2 3 4 5 6 file2.txt a b c d e f 现希望生成file3.txt 1 2 a b 3 4 c d 5 6 e f 则可以用到如下命令： 阅读全文

摘要： 以surfer 12版本为例： 1、下载世界地图，这里我随便提供一个范例（侵删，忘记出处了）； 2、进入surfer软件，选择“MAP”——“NEW”——“BASE MAP”。 以此按照以上步骤，在弹出的对话框中选中我们下载的世界地图，作为底图； 3、本文以采集中国北京、德国柏林、澳大利亚悉尼、美国 阅读全文

摘要： 一般来说有两种解决方案。 第一种：添加“--plink-tped”参数： 用vcftools的“--plink”参数生成plink格式文件时，小样本量测试可以正常生成plink格式，用大样本量时产生Writing PLINK PED and MAP files ... Error: Could no 阅读全文

摘要： 假设中性突变的频率分别为P和1-P，则其突变年龄为：-4Ne[p*( logep)+(1-p)* loge (1-p)] The average age of a neutral two-allele polymorphism with frequencies p and is 1-p：-4Ne[p 阅读全文

摘要： 正向选择：某一位点逐渐积累，成优势的位点，具体表现为：随着时间延长，该位点的突变allele频率越来越高，远远超过野生型allele； 中性选择：随着时间的延长，总体频率没有改变太多； 平衡选择：位点呈现多态性，且一直保持着平衡，人类的ABO血型系统就是典型的平衡选择； 具体示意图，可以见下图： 图 阅读全文

摘要： 1、下载安装bedtools； 2、生成bed文件；标准的bed文件格式如下： 如果你只有染色体、起始位置和终止位置信息的话，也无大碍。不大标准但是不伤大雅的bed文件格式如下： 3、提取多个位置的vcf文件； 阅读全文

摘要： 简单介绍两个网页工具，第一个是GGV,其界面如下： 第二个工具是HGDP,个人感觉画出来有点丑。。都是同一所大学开发出来的；界面如下： 阅读全文

摘要： 假设存在文件file1.xlsx，其内容如下： 存在文件file2.xlsx，其内容如下： 现在我想从第七列开始，将file2所有的字符替换成file1一样的，即第七、八、九、十列不需要改变，因为file1和file2的字符一致的（3和1,2和4）；从第11列开始，file1和file2的字符不一样 阅读全文