庐州月光

摘要： File::Spec 模块提供了很多的功能，这里只列举几个常用的函数 rel2abs : 返回一个文件的绝对路径， 常见用法，返回当前运行的perl脚本的绝对路径 代码示例： 其中 __FILE__ 是一个内置变量，代表当前脚本； splitpath : 将文件的路径进行分割，返回值为一个长度为3的 阅读全文

摘要： 今天看bowtie2的源代码的时候，发现有这样一段用法： 利用$^O 操作符判断当前操作系统的平台； $^O 支持多种操作系统平台，对于常见的平台，其返回值为： 其他的操作系统的返回值可以参见下面的链接： http://perldoc.perl.org/perlport.html#PLATFORMS 阅读全文

摘要： pch函数用来控制点的形状，这个参数不仅在par函数中有，在大多数的高级绘图函数中都有。 代码示例： 效果图如下： 从图中可以看出，pch 取不同的值时，点的形状不同。但是 21 和 1 的形状都为圆形，这两个形状相同吗？ 当然这两个形状不同是不同的，不同之处在哪呢，通过下面这个代码来看 效果图如下 阅读全文

摘要： 在R语言中, 绘图边框一共有3个区域： device region : figure region : plot region : 在描述不同区域大小的时候，有对应的不同参数： din : 返回device region 的宽度和高度， 单位为 inches fin : 返回figure regio 阅读全文

摘要： 在R语言中指定画图边框时，通常使用两种单位， lines 和 inches 当然，这两个单位之间是可以相互转换的，那么 1 inch = ? line 答案是1 inches = 5 lines 下面给出具体的分析过程： par 函数中有两个参数，返回的是margin的宽度，只不过单位不同： mar 阅读全文

摘要： 对于植物等真核生物基因组来说，重复序列， 多倍体，高杂合度等特征在利用二代数据进行组装的时候都会有很大的问题； 利用二代数据组装出来的基因组，大多达不到完成图的水准，通常只是覆盖到编码蛋白的基因区域，还是会有很多的区域覆盖不到，而这些区域正是发挥调控功能的非编码基因区域，近年来，非编码功能的研究越来 阅读全文

摘要： 在R语言中，会根据数据的范围自动计算x轴和y轴的范围，举个例子 比如绘制一个1到5的散点图：代码示例： 生成的图片如下： 从图片中我们可以看到，x轴的起始位置比1要小，终止范围比5要大，y轴也是同样的道理，那么x轴和y轴具体的范围是多少呢？ 这个问题的答案，其实就是usr 参数的值 在图片绘制完成之 阅读全文

摘要： family用于控制文字的字体， 标准的取值范围为serif, sans, mono， 其中sans 为默认值 基本用法,代码示例： par(mfrow = c(1,3)) par(cex = 1.5 , family = "serif")plot(1:5, 1:5, main = "family 阅读全文

摘要： fg参数用来控制前景色，其实指的就是x轴和y轴的轴线和刻度线的颜色 在R语言中，会根据fg, col 任何一个参数的值，自动的将两个参数的值设置为相同的值，举个例子： 直接R中运行上面的代码，就会发现，如果只指定fg/col 中的一个，另一个参数也会变成同样的值，所以为了准确的区分两个参数的作用，必 阅读全文

摘要： col参数用来控制颜色，其实有一些列的颜色相关的参数，都是以col 开头 col : 控制图片中点，文字以及绘图边框的颜色，代码示例： 效果图如下： 从效果图中可以看出，只有坐标系中的点和文字以及绘图边框的颜色发生了变化 col.main : 控制主标题main 的颜色， 代码示例： 效果图如下： 阅读全文