上一页 1 ··· 16 17 18 19 20

windows 下安装perl Tk 模块

摘要: 首先,安装activeperl ,安装过程中勾选自动添加PATH环境变量,这样安装后就不需要自己手动修改PATH环境变量;通过cmd 调出命令行窗口,输入ppm ,然后回车,就开启了perl 的包管理器,点击 仓库按钮, 在仓库中搜索Tk模块,然后右键,选择intall, 然后点击右上方的绿色箭头图... 阅读全文
posted @ 2015-12-15 10:09 庐州月光 阅读(2932) 评论(0) 推荐(1)

html 基础

摘要: 最近一直在用perl 写CGI,自己写的表达样式很丑, 决心好好看下前端的一些基本知识,先从html开始1)标题:h1, h2, h3, h4, h5, h5标题为快级元素,自己独占一行,其后面的元素会另起一行2) 段落p段落为块级元素,3) 强调:em: 默认斜体strong : 默认加粗span... 阅读全文
posted @ 2015-12-14 17:16 庐州月光 阅读(262) 评论(0) 推荐(0)

用grep 筛选fastq 序列

摘要: grep 从文件中筛选出 包含指定的字符或者正则表达式的行;默认只打印匹配到的行,比如一个文件 test.txt, 其内容为:abcdefghijklgrep a test.txt, 输出内容为:abc指定了-A参数后可以输出匹配行以及后面的几行grep -A 3 a test.txt, 输出内容为... 阅读全文
posted @ 2015-12-08 12:48 庐州月光 阅读(1651) 评论(0) 推荐(0)

php 统计fasta 序列长度和GC含量

摘要: 最近php7的消息铺天盖地, 忍不住想尝试下。星期天看了下语法, 写个小脚本练下手;这个脚本读取fasta 文件, 输出序列的长度和GC含量;/", $line)) { if ($id) { $meta[$id] = $seq; ... 阅读全文
posted @ 2015-12-08 12:24 庐州月光 阅读(758) 评论(0) 推荐(0)

perl 截取 fastq文件

摘要: #!/usr/bin/perl -wuse warnings;use strict;my $usage = qq{$0 input_fastq trim_length};die "$usage\n" if scalar @ARGV != 2;my ($fastq, $trim_length) = @... 阅读全文
posted @ 2015-12-01 12:33 庐州月光 阅读(1823) 评论(0) 推荐(0)
上一页 1 ··· 16 17 18 19 20