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摘要： HiCImpute 环境创建与安装流程 1. 环境说明 本教程用于在 Linux / HPC 集群环境中创建并安装 HiCImpute R 包。 当前测试环境： 系统架构：x86_64 环境管理工具：micromamba R 版本：4.4.1 编译器：Anaconda gcc / g++ 11.2. 阅读全文

摘要： /cdata 外挂目录共享 Micromamba 环境配置笔记 本文记录如何将 micromamba、conda/mamba 环境、package cache、pip cache 和常用模型缓存统一放到 /cdata 外挂目录中，供多个容器/用户共享使用。 适用场景： 多个容器共享同一个外挂硬盘 / 阅读全文

摘要： 问题描述： Claude Code 2.0 版本更新后，VSCode 插件启用了强制登录验证，要求使用官方账号，导致第三方中转 API 无法使用 VSCode 中的 Claude 插件。如下图所示。 解决方法： 通过修改 settings.json 来绕过登录限制。 示例： 在VSCode的用户se 阅读全文

摘要： git clone https@github.com:HuMingLab/SnapHiC.git cd SnapHiC/ micromamba create -n 10_snaphic_env -c https://repo.anaconda.com/pkgs/main -c https://rep 阅读全文

摘要： 如何安装claude code以及ccr code 1. 安装 node 1.1 node的常规安装（适用于linux18.04，linux20.04等新版本） 参考官网安装顺序：https://nodejs.org/en/download 1.2 常规安装失败，其他情况下node的安装（适用于li 阅读全文

摘要： 背景： 安装cluade code的前提是安装好版本号大于18的node。但是在工作场景中可能会遇到低版本Linux【16.04】下使用 nvm安装node后报错： (base) ******@ubuntu:~$ node -v node: /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so 阅读全文

摘要： 以厂商出厂时自带的驱动版本为第一优先 USB 无线 WIFI 设备驱动一般不需要更新，更新时也要先选择官方渠道更新​：从设备制造商官网官网下载驱动，避免从芯片厂商（如 Realtek）下载，因为芯片厂商的驱动可能并不会适配设备制造商的产品。 COMFAST AC-938 设备设备官方驱动包 http 阅读全文

摘要： 你问的scHi-C、scRNA、DNA损伤这三者主要是单细胞多组学领域常见的三种分析/表征内容，它们分别指： scHi-C（single-cell Hi-C）：单细胞水平的染色质高级结构（染色质空间互作/三维基因组）分析技术。 scRNA（single-cell RNA-seq）：单细胞转录组测序， 阅读全文

摘要： 好的，我先从基础概念、构建方式、在 scRNA-seq 中的作用，再到如何与 scHi-C 结合的角度，详细解释 共表达网络（Gene Co-expression Network）。 1. 什么是共表达网络？ 共表达网络（Gene Co-expression Network）是指： 根据基因在多个样 阅读全文

摘要： ✅ 问题背景 scHi-C 最大的问题是： 每个单细胞中观测到的染色质接触对非常稀疏（常仅几千对）， 无法完整重构 TAD、Loop 等三维结构。 而 其他单细胞组学数据（如 scRNA-seq、scATAC-seq） 则通常： 数据密度高 信噪比好 功能关联明确 因此，利用这些模态中的结构相关性、 阅读全文