摘要：
你问的scHi-C、scRNA、DNA损伤这三者主要是单细胞多组学领域常见的三种分析/表征内容，它们分别指： scHi-C（single-cell Hi-C）：单细胞水平的染色质高级结构（染色质空间互作/三维基因组）分析技术。 scRNA（single-cell RNA-seq）：单细胞转录组测序， 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:59
wuhaoliu
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摘要：
好的，我先从基础概念、构建方式、在 scRNA-seq 中的作用，再到如何与 scHi-C 结合的角度，详细解释 共表达网络（Gene Co-expression Network）。 1. 什么是共表达网络？ 共表达网络（Gene Co-expression Network）是指： 根据基因在多个样 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:49
wuhaoliu
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摘要：
✅ 问题背景 scHi-C 最大的问题是： 每个单细胞中观测到的染色质接触对非常稀疏（常仅几千对）， 无法完整重构 TAD、Loop 等三维结构。 而 其他单细胞组学数据（如 scRNA-seq、scATAC-seq） 则通常： 数据密度高 信噪比好 功能关联明确 因此，利用这些模态中的结构相关性、 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:44
wuhaoliu
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摘要：
由于 scHi-C（单细胞染色质构象捕获）接触矩阵极度稀疏，即每个细胞仅能观测到原始三维基因组结构中极小一部分接触对（通常仅数千对），所以需要特定的策略来缓解稀疏性，以便有效地重建结构特征如 TAD-like structures、Loops 或高阶构象。 ✅ 解决 scHi-C 接触矩阵稀疏的常用 阅读全文
posted @ 2025-07-24 20:42
wuhaoliu
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