摘要：
概念 生物标志物，即传说中的biomarker，是一类可测量的，用来表征疾病状态的物质，通常用于表征： 疾病的状态（是否为某种疾病/某种亚型）； 药物敏感性，用于用药指导； 生理状态监测。 类型 预后指标 预测疾病的预后效果（独立于治疗），如AB1-42可用于诊断老年痴呆预后。 预测型标志物 预测疾 阅读全文
posted @ 2020-12-30 11:51
生物信息与育种
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摘要：
非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取，一般要求每组至少10个样； 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC； 3.QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每十个样本穿插一个QC样本 。 得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。 峰表格式一般为：每行为一个m/z，每列为一个样本 数 阅读全文
posted @ 2020-12-30 11:49
生物信息与育种
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摘要：
代谢物的鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次，代谢组学比蛋白组又落后一档次，仅化合物的鉴定就让人头疼。 流程如下： 化合物精确质量数 数据库检索 一级鉴定（筛选分子量相同的离子）。解决质量数问题。 一级鉴定（通过同位素分布比对，筛选分子量和元素组成相同的离子）。解决同位素问题。 二级鉴定。通过 阅读全文
posted @ 2020-12-30 11:48
生物信息与育种
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摘要：
基本概念 代谢物：所有分子量小于1500Da的小分子物质，包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇、生物碱、小分子药物等等。 代谢组：一个细胞、组织、器官中所有代谢物的集合。 代谢组学：利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞、组织或器官中所有小分子或代 阅读全文
posted @ 2020-12-30 11:46
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