生物信息与育种

摘要： 背景 调控基因的表达可实现植物表型和重要农艺性状的定向改变 • SV影响基因表达 （2020，Cell: Major Impacts of Widespread Structural Variation on Gene Expression and Crop Improvement in Tomat 阅读全文

摘要： Plant Com | 浙大张国平&湖南农大吴德志：解析盐生植物海大麦基因组及其耐盐机制 The genome and gene editing system of sea barleygrass provide a novel platform for cereal domestication a 阅读全文

摘要： NG | 农科院油料所伍晓明&诺禾：揭示现代油菜遗传改良的基因组学基础 Genomic selection and genetic architecture of agronomic traits during modern rapeseed breeding 基于418份现代油菜种质高深度重测序数 阅读全文

摘要： 长读长组装发展 2012：三代组装、二代校正；耗资源，适合小基因组，如细菌，4-15%错误率 2013：三代组装、三代校正；仍然只适用小的 2014：华夏一号（中国人三代参考基因组） 2016：Falcon/Falcon-Unzip，三代Pacbio二倍体真核生物 2017：ONT UItralon 阅读全文

摘要：  阅读全文

摘要： The Crop Journal | 农科院深圳基因组所钱前&商连光&胡冠菁：利用GWAS和转录组解析水稻高温胁迫响应基因及其表达模式 Identifying candidate genes and patterns of heat-stress response in rice using a g 阅读全文

摘要： Genome Research | 上海交大&农科院作科所徐建龙：基于三代测序数据的水稻泛基因组构建及分析 Long-read sequencing of 111 rice genomes reveals significantly larger pan-genomes 该研究通过引入一系列新方法处 阅读全文

摘要： 用了这么久pheatmap包绘热图，自认为很娴熟了。但今天遇到了一件诡异的事，折腾了我一两个小时，记录备忘。 不加行注释时正常显示 pheatmap(pld, cluster_rows = F, cluster_cols = F, gaps_col = c(5,10,15,20), annotati 阅读全文

摘要： Hortic Res | 意大利巴里大学：基于不同种植地豌豆的基因型数据揭示豌豆遗传进化史 Merging genotyping-by-sequencing data from two ex situ collections provides insights on the pea evolutio 阅读全文

摘要： 1. 简介 Web Scraper是Chrome/Firefox浏览器插件，跨平台使用。 优点：使用简单，无需编程，鼠标点点就可；轻量快速爬取。 缺点：小数据量；不能爬图片；不能中止；整体较慢（网速影响可能不稳定）；爬取结果乱序。 2. 基础 chrome应用商店安装插件需要fanqiang，但凡用 阅读全文