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先来吐槽： 压箱底的文章，突然要发表，急匆匆的要俺插文献。 立即下载endnotex7，打开电脑，本以为word会自动和endnote关联上的， 因为以前的电脑上就是自动关联好的， MD，网上找了一上午操作指南，头都看炸啦，还没搞好，后来一想，还不如自己瞎搞。 吐槽完毕，正式开始了： 1.word系 阅读全文
posted @ 2017-09-11 15:26
遗世独立的愚公
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read：测序时，产生的较短的原始序列叫read contigs：有多个reads通过片段的重叠，组装成一个更大的read，称为contigs scaffold：多个contigs通过片段的重叠拼接成更长的scaffold； 从上面的解释来看，可以发现这些命名应该比价常出现在de novo拼接当中。 阅读全文
posted @ 2017-09-10 16:41
遗世独立的愚公
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1.单端测序还是双端测序 2.测序的读长是多少 3.是否建立链特异性库 4.需要多少的测序数据量（即测序深度是多少） 5.设置多少个生物学重复比较好 6.如果我们做了生物学重复还要做技术重复吗？ 相关答案： 至少需要三个重复 测序深度对结果的改善不如增加生物学重复 阅读全文
posted @ 2017-09-10 13:10
遗世独立的愚公
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1.本人刚开始安装的时候，先下载相关的软件包，然后安装installtion中的方法安装， 运行的时候老是报错。根据错误提示安装解决方法。也参考了其他的笔友的一些建议， 发现特别麻烦，后来无意中发现有小伙伴用bioconda来安装，一个命令，简单快捷。 2.bioconda安装HTSeq操作如下： 阅读全文
posted @ 2017-09-09 19:24
遗世独立的愚公
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#：正常情况下，以#开头的是注释。 #！：这个可不是注释喔。。。是用于指定当前脚本的注释器。后面应该接注释器的完整路劲。 如下： #！/bin/bash 或者 #!//usr/bin/python等 分号（；）：可以在同一行上写两个或两个以上的命令 such as： #!/bin/bash echo 阅读全文
posted @ 2017-09-03 21:12
遗世独立的愚公
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1.啥叫高通量测序 2.sanger测序法是什么 3.什么是全基因组重测序 4.de novo（是拉丁文喔）是什么意思？ 5.外显子测序 6.mRNA测序（RNA-seq） 7.small RNA测序 8.Chip-seq（染色质免疫共沉淀）测序 9.RIP（RNA免疫共沉淀-seq测序 10.宏基 阅读全文
posted @ 2017-09-01 10:33
遗世独立的愚公
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参考网站： https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247484588&idx=1&sn=c5f223baf14d5fba303e8d92ee6e441d&chksm=9b484417ac3fcd010e9f8756dd6bbd3 阅读全文
posted @ 2017-08-30 16:42
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参考网址 ： https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247484318&idx=1&sn=bb7fc36c73120945d7493e679744c0d6&chksm=9b484325ac3fca332cb38e31051e7d 阅读全文
posted @ 2017-08-30 15:44
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参考网址：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247484311&idx=1&sn=7845d8341562531e968598da685b38a4&chksm=9b48432cac3fca3aed2d57cc12d94eb5 阅读全文
posted @ 2017-08-30 14:42
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参考网址：http://blog.csdn.net/mtj66/article/details/57074986 【感谢原作者】 阅读全文
posted @ 2017-08-30 10:32
遗世独立的愚公
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