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摘要: 参考网址:http://www.biotrainee.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1750(感谢原作者) 阅读全文
posted @ 2017-08-28 09:38 遗世独立的愚公 阅读(326) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 参考网址:http://ju.outofmemory.cn/entry/193943 (感谢原作者) 阅读全文
posted @ 2017-08-28 09:35 遗世独立的愚公 阅读(231) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1.最近使用sudo apt-get install安装某些软件包时,发现总是报错: 下列软件包有未满足的依赖关系; checkinstall:依赖dpkg-dev但是它将不会被安装 推荐:make但是它将不会被安装。 2.通过百度搜索,找到一些解决办法: 需要进行包的升级和清理工作,只需要执行以下 阅读全文
posted @ 2017-06-14 10:45 遗世独立的愚公 阅读(428) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1.下载相关程序: 网址:http://homer.ucsd.edu/homer/download.html 下载其中名为configureHomer.pl的文件。 2.新建文件夹:homer mkdir homer 3.将刚下载的pl文件移至Homer文件夹中: mv configureHomer 阅读全文
posted @ 2017-06-13 15:03 遗世独立的愚公 阅读(4741) 评论(0) 推荐(1)
摘要: 1.下载MACS软件安装包(作者的系统为Ubuntu) 网址链接:http://liulab.dfci.harvard.edu/MACS/ 2.解压文件: tar -zxvf MACS**.tar.gz 3.更改文件夹的名字(个人习惯) mv MACS1.1-4 MACS 4.进入到MACS软件包 阅读全文
posted @ 2017-06-13 10:55 遗世独立的愚公 阅读(2469) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1.进入phred官网,给作者写信,获得所需的软件,大约需要两三天的时间即可收到回信。 2.根据作者的指示下载,解压相应软件。 3.以笔者本人的安装为例unbuntu系统(phred自带的installtion太麻烦了) 4.新建文件夹: mkdir phred 5:将下载的压缩文件移到新建的文件夹 阅读全文
posted @ 2017-05-28 16:12 遗世独立的愚公 阅读(1069) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1.下载相关软件,网址:http://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimmomatic,它有源代码和二进制两种文件(建议都下载,然后合并成一个文件,因为里面的文件之间有互补性) 2.解压:unzip trimmomatic.zip 添加至环境变量中 v 阅读全文
posted @ 2017-05-26 10:19 遗世独立的愚公 阅读(1111) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 1.fastqc是在Java环境下运行的;所以在安装fastqc之前,Linux下要有相应的Java运行环境(JRE).且java的版本应该在1.8.0版以上 2.java的安装:下载最新版本的Java,注意要下载带有JRE的版本。 3.解压:tar -zxvf java.tar.gz 4.cd j 阅读全文
posted @ 2017-05-24 18:36 遗世独立的愚公 阅读(6310) 评论(0) 推荐(0)
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